| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,063,721 | IS1 (–) +9 bp | coding (567‑575/693 nt) | ompL ← | putative outer membrane porin L |
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Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
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1:1121686‑M2/136‑87 (MQ=255) ttCGAAATAAGGGAGCCAGTGTTCATTAATACGGTAACGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgac < 1:975498‑M2/140‑95 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTAt > 2:789001‑M2/38‑140 (MQ=255) cGAAATAAGGGAGCCAGTGTTCATTAATACGGTAACGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 2:163411‑M2/1‑44 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGAttt < 1:789001‑M2/112‑1 (MQ=255) gggAGCCAGTGTTCATTAATACGGTAACGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccca < 2:158640‑M2/140‑105 (MQ=255) 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1:668712‑M2/124‑1 (MQ=255) ttggcagcatcaccCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAg > 1:268237‑M2/15‑140 (MQ=255) cATTAATACGGTAACGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg > 2:491585‑M2/1‑23 (MQ=255) cATTAATACGGTAACGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg > 1:505733‑M2/1‑23 (MQ=255) ttAATACGGTAACGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct > 2:4966‑M2/1‑21 (MQ=255) ggcagcatcaccCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGt > 1:628146‑M2/13‑140 (MQ=255) agcatcaccCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGt > 1:1165730‑M2/10‑133 (MQ=255) agcatcaccCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGcc < 2:74335‑M2/131‑1 (MQ=255) agcatcaccCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGcc < 1:1010103‑M2/131‑1 (MQ=255) aTACGGTAACGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcc > 1:720166‑M2/1‑18 (MQ=255) cGGTAACGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctca < 2:940246‑M2/140‑126 (MQ=255) tAACGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagat < 1:236635‑M2/140‑129 (MQ=255) ccCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCa > 2:309716‑M2/3‑140 (MQ=255) cCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCAt < 1:436415‑M2/139‑1 (MQ=255) cCGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCAt < 1:447585‑M2/139‑1 (MQ=255) cGGAAGGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattca < 1:455990‑M2/140‑132 (MQ=255) aaGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTg > 2:1052285/1‑126 (MQ=255) ggTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGgtgt < 1:309716/140‑1 (MQ=255) tgtTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCa < 1:638252/140‑1 (MQ=255) | CGGCAGTTTCACATCAGAAGAAATACTTCGTCCCGATACGGATCTGGTTTTGCTCGCGGTGGTACGGTTCGACGTTGCGGTCTAACCAGCGCAATTCGAAATAAGGGAGCCAGTGTTCATTAATACGGTAACGGAAGGTGTTAGTGATTTCCCAATGATGATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCA > NC_000913/4063590‑4063867 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |