| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,640,748 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (+206/‑191) | yjjY → / → yjtD | protein YjjY/putative rRNA methyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 49 (1.140) | 35/276 | 0.2 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4640748 = | 0 (0.000) | intergenic (+206/‑194) | yjjY/yjtD | protein YjjY/putative rRNA methyltransferase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 56 (1.310) | 41/276 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4640751 | 0 (0.000) | intergenic (+209/‑191) | yjjY/yjtD | protein YjjY/putative rRNA methyltransferase | |||||
GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289974‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTTCATCAAACTGTTAA < NC_000913/4640751‑4640614 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC < 1:724062/140‑1GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC > 1:78047/1‑140GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC > 2:686719/1‑140GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC > 2:561558/1‑140GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC < 2:146119/140‑1GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC < 2:209030/140‑1GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC > 1:412190/1‑140 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:264320/140‑1 AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:454014/140‑1 AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGACGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:440627/140‑1 AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:590159/140‑1 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG > 1:330763/1‑140 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG > 2:281302/1‑140 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG > 1:507064/1‑140 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG > 1:437571/1‑140 GGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATA < 2:69033/140‑1 GCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAAT > 2:698342/1‑140 TACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTC < 1:454683/140‑1 CTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGA < 1:698342/140‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATTATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCAC < 2:333487/140‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCAC > 1:206326/1‑140 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACC < 1:616544/140‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACC < 1:238936/140‑1 CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGACTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCAC > 2:453417/1‑140 GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTT < 2:206326/140‑1 AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTA < 1:305930/140‑1 GGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATT > 2:39847/1‑140 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAG < 2:210092/140‑1 AGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTT < 1:485672/140‑1 GTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATCAGTTG < 1:376848/140‑1 TGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTA < 2:705344/140‑1 ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATG < 1:637576/140‑1 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGC < 1:134497/140‑1 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGC < 2:333255/140‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAA < 1:659031/140‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAA < 1:52914/140‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAAC > 1:147767/1‑140 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAAC > 1:296675/1‑140 AACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTG > 1:591410/1‑140 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGG < 1:663167/140‑1 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTAT > 2:552743/1‑140 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTAT > 1:556837/1‑140 TCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTAT‑AAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAA > 1:474624/1‑140 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAAT > 1:712443/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGT > 1:496257/1‑140 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGAC > 2:668945/1‑140 CAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAG > 2:606317/1‑140 AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGC < 1:580405/140‑1 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCT < 2:520504/140‑1 TGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCA < 1:275681/140‑1 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTT > 1:348546/1‑140 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATAC > 2:668082/1‑140 GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATG > 1:236015/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGA > 2:142390/1‑140 ACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATT < 2:572161/140‑1 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTT > 1:282101/1‑140 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTT > 2:501018/1‑140 GTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTTCAT > 1:496140/1‑140 GTTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTTCAT > 1:474151/1‑140 TTCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTTCATC > 2:705109/1‑140 TCGCACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTTCATCA < 2:348546/140‑1 CACCTTCCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTTCATCAAAC > 2:356263/1‑140 CCTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTTCATCAAACTGTTAA > 2:150019/1‑140 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289974‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGGATAATTTTATAAAAAATAAATCTCGACAATTGGATTCACCACGTTTATTAGTTGTATGATGCAACTAGTTGGATTATTAAAATAATGTGACGAAAGCTAGCATTTAGATACGATGATTTCATCAAACTGTTAA < NC_000913/4640751‑4640614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |