| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 391,045 | IS2 (–) +5 bp | pseudogene (795‑799/1458 nt) | yaiT → | putative autotransporter YaiT |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 254 (1.620) | 93/274 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 391045 = | 0 (0.000) | pseudogene (795/1458 nt) | yaiT | putative autotransporter YaiT | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 252 (1.590) | 113/276 | 0.0 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 391049 | 0 (0.000) | pseudogene (799/1458 nt) | yaiT | putative autotransporter YaiT | |||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381399‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aCTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCC > NC_000913/391045‑391180 TGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACgcc > 2:973637/1‑137 TGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTT > 2:309095/1‑140 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TCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGAT > 1:1488670/1‑140 TCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGAT > 1:1630719/1‑140 TCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAA > 1:666925/1‑133 GCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAA < 1:2371868/140‑1 TTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGA < 1:1559488/140‑1 TCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAG > 1:885963/1‑140 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TGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATT > 1:1281235/1‑140 TGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATT > 2:1290185/1‑140 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCA > 2:2282572/1‑140 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCA > 1:1680392/1‑140 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCT < 1:1764778/130‑1 CTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAA > 2:2081368/1‑140 GAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGC > 2:677035/1‑140 GATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTG < 1:1926112/140‑1 ATTCAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGA > 2:664191/1‑140 CAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGG < 1:2075503/140‑1 CAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGG < 2:1719310/140‑1 CAGGGGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGG > 1:21423/1‑140 GGGCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGA > 2:1450216/1‑140 GCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATG < 2:46502/140‑1 GCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATG < 2:1840131/140‑1 GCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATG < 2:1613009/140‑1 GCCAGTCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATG < 1:720692/140‑1 GCCAGTCTACTTGTGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCGCGGGTGATGTTGCTATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAGCAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATG < 2:2495460/140‑1 TCTACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATTTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCC < 2:404718/140‑1 TACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTG < 2:1960202/123‑1 CCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381399‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aCTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCC > NC_000913/391045‑391180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |