| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 391,045 | IS2 (–) +5 bp | pseudogene (795‑799/1458 nt) | yaiT → | putative autotransporter YaiT |
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| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 252 (1.590) | 113/276 | 0.0 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 391049 | 0 (0.000) | pseudogene (799/1458 nt) | yaiT | putative autotransporter YaiT | |||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
TTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/382452‑382590‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTT < NC_000913/391049‑390912 TGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACA > 2:1193348/1‑140 TGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACA > 1:1758543/1‑140 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ATAGGGGCAAATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTACCCCAAGTATGAGATTCGG > 1:1622793/1‑123 TAGGGGCAAATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGT < 2:1274350/140‑1 TAGGGGCAAATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGT < 2:1423246/140‑1 TAGGGGCAAATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCACAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGT > 2:2333574/1‑140 GGGGCAAATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAA > 1:2275822/1‑140 GGGCAAATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAG > 1:1279841/1‑140 GGCAAATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGT > 1:1190570/1‑140 CAAATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTAT > 2:474751/1‑140 CAAATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTAT < 1:2104410/140‑1 AATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTA > 1:2500002/1‑140 ATCCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTAC > 1:1400371/1‑140 CCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCT < 2:2624191/140‑1 CCACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCT < 2:2398969/140‑1 CACAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTT < 2:2494758/140‑1 TTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/382452‑382590‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAAAGTGACCAGTTTTGCCATAAGTATTGCTATCCAGGATATAATTTGAACCCGAAGTCACTGTGGAATCTTTTACAGAGATATTGTTATCCCAAGTATGAGATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTT < NC_000913/391049‑390912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |