| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,744,255 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (+45/‑70) | yiaL → / → yiaM | DUF386 domain‑containing protein YiaL/2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 141 (1.350) | 66/276 | 0.2 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3744255 = | 0 (0.000) | intergenic (+45/‑73) | yiaL/yiaM | DUF386 domain‑containing protein YiaL/2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 126 (1.210) | 70/276 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3744258 | 0 (0.000) | intergenic (+48/‑70) | yiaL/yiaM | DUF386 domain‑containing protein YiaL/2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289975‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTGAACATCCTGC < NC_000913/3744258‑3744120 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCATATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 1:1728695/1‑140 AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:680292/140‑1 AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:1566716/140‑1 AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:477462/140‑1 AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:569313/140‑1 AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:34802/140‑1 ATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 2:1656002/140‑1 ATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 1:767195/140‑1 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCA > 2:152097/1‑140 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCA < 1:832737/140‑1 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCA < 2:1338917/140‑1 TTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAA < 2:1534289/140‑1 TTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAA < 1:855215/140‑1 TTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAAT > 1:1051556/1‑140 TCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAA < 1:835106/140‑1 GTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGTCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATT > 2:920899/1‑140 TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACC > 2:1198615/1‑140 GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCC < 2:139113/140‑1 CTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTT < 1:436093/140‑1 TTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTC < 2:1293666/140‑1 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GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCT > 1:1455227/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCT > 1:736558/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCT < 2:157463/140‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCA < 2:366984/129‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCA > 1:366984/1‑129 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTG > 2:561371/1‑140 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGT > 1:37580/1‑140 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGT > 2:512748/1‑140 TTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTC < 2:465706/140‑1 TGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATA > 1:1175447/1‑129 TGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATA < 2:1175447/129‑1 TGTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAA‑TTTTCGGATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGG > 1:1631729/1‑140 GTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGG > 1:828956/1‑140 GTTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGG > 1:1324798/1‑140 TTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCTATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGT > 1:502127/1‑140 TTCGCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGT > 1:1551083/1‑140 GCACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCTATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTGAA < 2:502127/140‑1 CACCTTCCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTGAAC < 2:1014852/140‑1 CCTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTGAACATCCTG > 2:1270129/1‑140 CTTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTGAACATCCTGC < 2:828956/140‑1 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289975‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGAGCAATAACATTACCCAGGCGTTCTGGCGTAGACGATTATTCGATTAATTCAGCGCCGTTAATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTGAACATCCTGC < NC_000913/3744258‑3744120 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |