| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,744,255 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (+45/‑70) | yiaL → / → yiaM | DUF386 domain‑containing protein YiaL/2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3744255 = | 0 (0.000) | intergenic (+45/‑73) | yiaL/yiaM | DUF386 domain‑containing protein YiaL/2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 126 (1.210) | 70/276 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3744258 | 0 (0.000) | intergenic (+48/‑70) | yiaL/yiaM | DUF386 domain‑containing protein YiaL/2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit | |||||
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CGCAGGATGTTCACCGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACA > NC_000913/3744119‑3744397 | taacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTaa < 1:943170‑M2/4‑1 (MQ=255) gCAGGATGTTCACCGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAg < 2:828956‑M2/140‑2 (MQ=255) aacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTaa > 1:539736‑M2/136‑139 (MQ=255) aacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAAc < 1:795470‑M2/5‑1 (MQ=255) aacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAAc < 1:346972‑M2/5‑1 (MQ=255) taaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAACTATAtt < 2:329481‑M2/11‑1 (MQ=255) gTTCACCGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtg < 2:1014852‑M2/140‑9 (MQ=255) ttCACCGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATAGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgc < 2:502127‑M2/140‑10 (MQ=255) aCCGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaa > 1:1551083‑M2/1‑128 (MQ=255) ccGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaac > 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gaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAACTATATTAATAATTCa < 2:900202‑M2/20‑1 (MQ=255) gaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAACTATATTAATAATTCa < 1:436463‑M2/20‑1 (MQ=255) aCCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaag > 2:512748‑M2/1‑124 (MQ=255) aagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAACTATATTAATAATTCAg > 1:1215168‑M2/120‑140 (MQ=255) cAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtc > 2:561371‑M2/1‑122 (MQ=255) aGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtcc > 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taaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGcaca > 2:16604‑M2/109‑140 (MQ=255) tGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgaga < 1:515206‑M2/140‑31 (MQ=255) tGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtcc > 1:366984‑M2/1‑110 (MQ=255) gCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtccct < 1:1341832‑M2/130‑22 (MQ=255) gCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtccct > 2:1341832‑M2/1‑109 (MQ=255) cAAACAGCCTCTGAGATACGAAAA‑TTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatca < 2:1448068‑M2/140‑34 (MQ=255) 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cttattcgcaccttccCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTcc > 2:1723419‑M2/17‑140 (MQ=255) ttattcgcaccttccCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCt < 1:1606129‑M2/125‑1 (MQ=255) ttattcgcaccttccCTAACTATATAAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCt < 1:896984‑M2/125‑1 (MQ=255) ggTAATGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtca > 2:1198615‑M2/1‑19 (MQ=255) tattcgcaccttccCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCtg > 2:946327‑M2/15‑140 (MQ=255) tGTTATTGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagacca < 2:445621‑M2/140‑127 (MQ=255) gcaccttccCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCtgtattg < 2:924906‑M2/131‑1 (MQ=255) cttccCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTc < 1:430032‑M2/123‑1 (MQ=255) cttccCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTgtattgtatt > 2:795777‑M2/6‑140 (MQ=255) tGCTCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaag > 2:152097‑M2/1‑8 (MQ=255) tccCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCtgta < 2:1263890‑M2/128‑1 (MQ=255) tccCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTta > 1:268824‑M2/4‑140 (MQ=255) tAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagatt < 2:34802‑M2/140‑138 (MQ=255) tAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagatt < 1:477462‑M2/140‑138 (MQ=255) aaggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattt < 2:1566716‑M2/140‑139 (MQ=255) aggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatatggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagatttt > 1:1728695‑M2/1‑1 (MQ=255) aCTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACa < 1:688894/140‑1 (MQ=255) | CGCAGGATGTTCACCGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACA > NC_000913/3744119‑3744397 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |