| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1163010 | 115 (1.100) | 3 (0.030) | 3/272 | 8.9 | 2.6% | coding (373/642 nt) | lpoB | outer membrane lipoprotein ‑ activator of MrcB activity |
| ? | NC_000913 | 1163014 = | 115 (1.120) | coding (377/642 nt) | lpoB | outer membrane lipoprotein ‑ activator of MrcB activity | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAA > NC_000913/1162878‑1163146 | aaTGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAAGGCGGCaaaa > 1:1545228/1‑140 (MQ=255) aTGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAAt > 1:1764731/1‑140 (MQ=255) gcgcAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg < 1:1624578/140‑1 (MQ=255) gcgcAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg < 2:1764731/140‑1 (MQ=255) gcgcAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg < 1:682566/140‑1 (MQ=255) cgcAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcgc > 1:1095732/1‑140 (MQ=255) cgcAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcgc > 1:1324005/1‑140 (MQ=255) cgcAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcgc > 1:955871/1‑140 (MQ=255) gcAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATg > 1:288690/1‑136 (MQ=255) gcAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATg < 2:288690/136‑1 (MQ=255) aaTGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTgg < 1:1373454/140‑1 (MQ=255) tGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg < 2:1486957/134‑1 (MQ=255) tGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg > 1:1486957/1‑134 (MQ=255) tGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCt > 1:1655074/1‑140 (MQ=255) tGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCt > 1:1486240/1‑140 (MQ=255) tGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCt > 2:967107/1‑140 (MQ=255) gATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACg < 1:486381/140‑1 (MQ=255) aTGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACgg > 2:1081544/1‑140 (MQ=255) gTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAAttt > 2:895359/1‑140 (MQ=255) gATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTAccc < 1:967107/140‑1 (MQ=255) tGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACgg > 1:1397802/1‑127 (MQ=255) tGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACgg < 2:1397802/127‑1 (MQ=255) tGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGAAAATTTACCCTg > 2:1392029/1‑140 (MQ=255) cTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAAtt < 1:778454/131‑1 (MQ=255) cTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAAtt > 2:778454/1‑131 (MQ=255) cTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGt < 2:1324005/140‑1 (MQ=255) ttGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACTGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGtt > 1:912189/1‑140 (MQ=255) ggggCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTc < 2:948032/140‑1 (MQ=255) ggggCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTc > 2:286699/1‑140 (MQ=255) ggggCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTc > 1:1141944/1‑140 (MQ=255) cTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGcc > 1:103601/1‑140 (MQ=255) cTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGcc > 2:879738/1‑140 (MQ=255) aCGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAg < 1:1386729/140‑1 (MQ=255) cGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGc > 2:1188972/1‑140 (MQ=255) ggggTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCa < 1:1650512/140‑1 (MQ=255) gggTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCaa < 2:1531774/140‑1 (MQ=255) gTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACt < 1:479430/140‑1 (MQ=255) gTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCg > 2:1221491/1‑140 (MQ=255) gCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAg < 2:1190684/140‑1 (MQ=255) gCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGG‑AATTTACCCTGGGTTCCGCCCAGCAACTGTCGGTTGCGAAGc > 2:1668860/1‑140 (MQ=255) gTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCa > 2:1650101/1‑140 (MQ=255) ccTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAAc > 2:517960/1‑140 (MQ=255) ctgctgGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGc < 1:304849/136‑1 (MQ=255) ctgctgGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGc > 2:304849/1‑136 (MQ=255) tgctgGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAg > 2:701245/1‑140 (MQ=255) gTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑gg > 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tAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGt < 1:149416/140‑1 (MQ=255) ttAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTcgccg > 1:1210610/1‑140 (MQ=255) ttAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTcgccg < 1:1221491/140‑1 (MQ=255) ttAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTcgccg > 2:1117613/1‑140 (MQ=255) aacaacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCa > 1:245928/1‑140 (MQ=255) acaacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAg > 1:1709070/1‑140 (MQ=255) acaacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAAC‑‑‑GCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGAc < 1:856352/140‑1 (MQ=255) caacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAgg < 1:602090/140‑1 (MQ=255) caacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAgg < 1:1061346/140‑1 (MQ=255) caacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAgg < 2:1504457/140‑1 (MQ=255) aacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGa < 1:580165/140‑1 (MQ=255) aacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGa < 2:7188/140‑1 (MQ=255) aacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGa < 1:981086/140‑1 (MQ=255) aacCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGa > 1:413836/1‑140 (MQ=255) tACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTcgccg > 2:1014763/1‑130 (MQ=255) tACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTcgccg < 1:1014763/130‑1 (MQ=255) aCTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTCTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGttt > 1:72758/1‑140 (MQ=255) tAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAg < 2:413836/140‑1 (MQ=255) tAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTCTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAg < 2:72758/140‑1 (MQ=255) aCGGTTCGCTGAATACCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACGCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGc > 1:1527629/1‑140 (MQ=255) gTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCAcc < 1:599502/140‑1 (MQ=255) gTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCAcc < 2:1721063/140‑1 (MQ=255) ttCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCAccc < 1:146712/140‑1 (MQ=255) tCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAgg < 2:124402/134‑1 (MQ=255) tCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAgg > 1:124402/1‑134 (MQ=255) tCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCg < 1:882784/140‑1 (MQ=255) cGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAgg < 2:1734549/133‑1 (MQ=255) cGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAgg > 1:1734549/1‑133 (MQ=255) cGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCgt > 2:1566324/1‑140 (MQ=255) cGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCg > 1:237325/1‑139 (MQ=255) cGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCg < 2:746864/139‑1 (MQ=255) cGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCg < 2:71238/139‑1 (MQ=255) cGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCg > 1:746864/1‑139 (MQ=255) cGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCg > 1:71238/1‑139 (MQ=255) gCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCgta > 1:1570082/1‑140 (MQ=255) cTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCAcc < 1:1081544/140‑1 (MQ=255) cTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCgtag < 1:517960/140‑1 (MQ=255) gAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCgtagta < 1:1117613/140‑1 (MQ=255) gAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCgtagta < 1:1392029/140‑1 (MQ=255) gAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCgtagta < 1:985802/140‑1 (MQ=255) gAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCgtagta < 2:24902/140‑1 (MQ=255) gAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCgtagta < 1:1201927/140‑1 (MQ=255) aaTGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGGAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTaa < 2:955871/140‑1 (MQ=255) aaTGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTaa < 2:1095732/140‑1 (MQ=255) aaTGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTaa < 2:1709070/140‑1 (MQ=255) aTGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTaaa < 1:70678/140‑1 (MQ=255) gCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGc > 2:746161/1‑140 (MQ=255) cAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATa > 2:591858/1‑140 (MQ=255) aGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCa < 1:423977/140‑1 (MQ=255) | AATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTA‑‑‑‑‑GGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAA > NC_000913/1162878‑1163146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |