| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 608010 = | NA (NA) | 56 (0.840) | 40/274 | 0.5 | 94.9% | noncoding (4/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1503204 | 3 (0.050) | noncoding (44/1748 nt) | IS609 | repeat region | |||||
CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608149‑608010‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGTCATCAATAACTTG < NC_000913/1503204‑1503069 CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCGGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 2:381274/1‑140CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:1040582/1‑140CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:1070143/1‑140CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 2:410740/1‑140 GGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGC < 2:653855/140‑1 GGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGC > 2:566412/1‑140 GGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGC < 2:218289/140‑1 CGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATAT > 1:26519/1‑140 TGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCC < 2:26519/140‑1 TGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCC < 2:1040582/140‑1 CCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCC > 2:364988/1‑140 AAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCC < 2:1043116/140‑1 AGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCC > 2:414462/1‑140 AGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAGCCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGA < 2:615817/140‑1 AGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGA < 1:433653/140‑1 AGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGA < 1:566412/140‑1 GGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCA > 2:595961/1‑135 GGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCA < 1:595961/135‑1 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATA > 1:415629/1‑140 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATA > 2:623935/1‑140 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATA > 2:486997/1‑140 CAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAA > 2:261213/1‑140 AATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAG < 1:364988/140‑1 ATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGC < 1:261213/140‑1 TTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGA > 1:536806/1‑140 TCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGG < 1:623935/140‑1 GAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTC < 1:486997/140‑1 GAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTC < 2:536806/140‑1 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCT > 2:911190/1‑140 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCT > 2:797435/1‑140 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCT > 1:370227/1‑140 ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTGGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAA > 2:567825/1‑140 ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAA < 1:797435/140‑1 ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCG < 2:1002923/131‑1 ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCG > 1:1002923/1‑131 CGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACTACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTT > 1:480799/1‑140 CGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTT > 2:402534/1‑140 CGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTT > 2:368186/1‑140 GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTT > 1:1086909/1‑140 ATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAAC > 2:126942/1‑140 ATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAAC > 2:692443/1‑140 CAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAA < 1:1113140/137‑1 CAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAA > 2:1113140/1‑137 AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCA > 2:666064/1‑140 ACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTC > 1:730272/1‑140 CCCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCA > 1:1114541/1‑140 CCCTTAAGTTAGCGCTTATACCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGCCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCA > 2:813959/1‑140 CCTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCAT < 1:666064/140‑1 CTTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATG < 1:692443/140‑1 CTTAAGTTAGCGCTTATACCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATG < 1:813959/140‑1 TTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGT > 1:138989/1‑140 TTAAGTTAGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGT < 2:730272/140‑1 AGCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGTCATCAAT > 1:401293/1‑140 GCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCC < 2:219228/128‑1 GCGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCC > 1:219228/1‑128 CGCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGTCATCAATAA > 2:76950/1‑140 GCTTATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGTCATCAATAAC < 2:1114541/140‑1 TATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGTCATCAATAACTTG > 1:967997/1‑140 ATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGTCATCAATAAC < 1:509586/136‑1 ATGCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGTCATCAATAAC > 2:509586/1‑136 CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608149‑608010‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gCCTTATATCCCCGCCCTGAAGGATGGGGTTTTACGGCGCACCGGATAAAAAGCGCCATCTAACGATGGCGCGTCTGGAACTACTTTTTGTTAACGTCAAACATGGTGGCATCGGTCGCCATGTCATCAATAACTTG < NC_000913/1503204‑1503069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |