| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 584,565 | IS1 (–) +9 bp | intergenic (+135/+107) | appY → / ← ompT | DNA‑binding transcriptional activator AppY/outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 48 (0.850) | 36/276 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 584565 = | 0 (0.000) | intergenic (+135/+115) | appY/ompT | DNA‑binding transcriptional activator AppY/outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b) | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 584573 | 0 (0.000) | 78 (1.380) | 52/276 | 0.1 | 100% | intergenic (+143/+107) | appY/ompT | DNA‑binding transcriptional activator AppY/outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b) |
| ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
GATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/258539‑258675‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAG > NC_000913/584565‑584702 GATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTA > 2:741019/1‑140GATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTA > 1:322727/1‑140 ATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTAT > 2:13395/1‑140 CTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAA > 2:367453/1‑140 TTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATA < 2:322727/140‑1 CCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCT < 2:218842/140‑1 CCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTA < 1:249942/140‑1 CCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTA < 1:443883/140‑1 CCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTA < 1:308458/140‑1 GTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTT < 1:283382/140‑1 GTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAA > 2:183350/1‑135 GTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAA < 1:183350/135‑1 AGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAA < 1:446075/140‑1 GACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAA < 2:351493/140‑1 GACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAA < 2:864750/140‑1 ACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAAT > 2:367864/1‑140 GCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGC < 2:902035/140‑1 AAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGG > 1:40244/1‑140 GCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGG < 2:240690/140‑1 ACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGA > 2:423288/1‑140 TGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATT > 1:840477/1‑140 GGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTT > 2:239043/1‑140 AGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGCTATTTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTC > 2:739054/1‑140 ACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACC > 1:893137/1‑140 CCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTATTAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTT > 1:359838/1‑140 CACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGC < 1:822224/140‑1 ACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCG > 1:798640/1‑140 ACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCG < 2:212365/140‑1 ACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCG < 2:287638/140‑1 TAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTT > 1:811281/1‑140 AATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCT > 1:468682/1‑140 ATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTT < 1:265417/140‑1 ATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTCTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTT < 2:800864/140‑1 CAGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAA > 1:119133/1‑140 AGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAA < 1:226695/140‑1 AGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAA < 2:798640/140‑1 AGTAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAA < 2:391408/140‑1 TAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAAT > 2:634789/1‑140 TAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAAT > 2:307941/1‑140 TAAGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAAT < 1:396803/140‑1 AGTTGGCAGCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGT < 1:192521/140‑1 GCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAA > 2:604972/1‑140 GCATCACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAA > 1:214621/1‑140 CACCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACC < 2:472586/140‑1 CCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAG > 1:200218/1‑140 CCCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAG > 1:189046/1‑140 CCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACC < 2:130451/137‑1 CCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACC > 1:130451/1‑137 GATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/258539‑258675‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAG > NC_000913/584565‑584702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |