| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 2,104,153 | IS1 (–) +9 bp | coding (349‑357/1119 nt) | wbbK ← | putative lipopolysaccharide biosynthesis protein |
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| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 38 (0.820) | 32/278 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2104153 = | 0 (0.000) | coding (357/1119 nt) | wbbK | putative lipopolysaccharide biosynthesis protein | |||||
AATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACACTGCAGTATTTTTTTTAATGTTTATTTTATATATCAGCCCGTATAGCATTTTAAATAAGAAAAAGCTAGGCTCCATAAGAATTTCACGGAATAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAGGGTTATGACAATACACATATCTTTTTTTAGTGACGACATTGGCCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATA > NC_000913/2104014‑2104290 | aaTATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACACTGCAGTATTTTTTTTAATGTTTATTTTATATATCAGCCCGTATAGCATTTTAAATAAGAAAAAGCTAGGCTCCATAAGAATTTCACGGAAt > 1:236977/1‑140 (MQ=255) gatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTaa < 1:12024‑M2/3‑1 (MQ=255) atgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTaaa > 1:618084‑M2/137‑140 (MQ=255) tttCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACACTGCAGTATTTTTTTTGATGTTTATTTTATATATCAGCCCGTATAGCATTTTAAATAAGAAAAAGCTAGGCTCCATAAGAATTTCACGGAATaaaa > 2:424080/1‑140 (MQ=255) 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2:607996‑M2/140‑124 (MQ=255) catcaccTAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAGGGTTATGACAATACACATATCTTTTTTTAGTGACGACATTGGCCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACt > 1:728439‑M2/8‑140 (MQ=255) caccTAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAGGGTTATGACAATACACATATCTTTTTTTAGTGACGACATTGGCCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACa > 2:319236‑M2/5‑140 (MQ=255) caccTAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAGGGTTATGACAATACACATATCTTTTTTTAGTGACGACATTGGCCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACa > 2:741860‑M2/5‑140 (MQ=255) aaTAAAATTCCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgtgaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagatt > 2:762994‑M2/1‑11 (MQ=255) aaTAAAATTCCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagatt < 2:618737‑M2/140‑130 (MQ=255) | AATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACACTGCAGTATTTTTTTTAATGTTTATTTTATATATCAGCCCGTATAGCATTTTAAATAAGAAAAAGCTAGGCTCCATAAGAATTTCACGGAATAAAATTCCTTTATAAAAAGGTGCAGGGTTATGACAATACACATATCTTTTTTTAGTGACGACATTGGCCGTAATATCATGCAGACAAATCCAATGCGTAGCATTCAGCTCTTTTGAAAGTTTTTTACAAACTACATA > NC_000913/2104014‑2104290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |