| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,581,699 | (19-bp)2→1 | intergenic (+60/+17) | tktB → / ← ypfG | transketolase 2/DUF1176 domain‑containing protein YpfG |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2581699 | 2581717 | 19 | 52 [0] | [0] 52 | tktB/ypfG | transketolase 2/DUF1176 domain‑containing protein YpfG |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2581698 | NA (NA) | 50 (0.570) | 41/238 | 0.8 | NA | noncoding (36/36 nt) | other | REP179b |
| ? | NC_000913 | 2581718 = | NA (NA) | intergenic (+79/+16) | tktB/ypfG | transketolase 2/DUF1176 domain‑containing protein YpfG | |||||
TCTGCTCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2581544‑2581698‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTG > NC_000913/2581718‑2581850 TCTGCTCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGT < 1:1240923/140‑1 CTGCTCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTC < 1:554871/140‑1 TCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTAT < 2:1699237/140‑1 GGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCG < 1:1557279/140‑1 CCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGC > 1:124190/1‑140 TCTTTGGTTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTT < 2:1670194/140‑1 TTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGT > 2:1231035/1‑140 GGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTT < 2:1177599/140‑1 TTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAAC < 2:124190/140‑1 TTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACG > 2:346797/1‑140 ACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGG > 2:1339114/1‑140 ACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGG < 1:1231035/140‑1 ACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGG > 1:207538/1‑140 CCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGTCGCTGACGCGTCTTATCCGCCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTGACGGGT < 2:571893/140‑1 CCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGT > 1:878550/1‑140 CGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCAAAAGGTGGTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGTTGATTGCCGGATGCGACGCGGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTG < 2:695170/140‑1 GCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGA < 1:1339114/140‑1 CGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATC > 1:1326356/1‑140 GAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCC < 1:643194/140‑1 ATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACG < 1:617422/140‑1 GTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGG < 1:792246/140‑1 TGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGG > 2:435978/1‑140 CAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCA > 2:1083782/1‑140 CAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCA < 2:1556688/140‑1 CAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCA > 1:1713315/1‑140 CAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCA > 1:1610103/1‑140 CAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGGGGGCCA > 2:1390003/1‑140 CGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTC < 1:1614366/140‑1 aAAGGTGCGGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGCCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGC < 2:772994/139‑1 TGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATG > 2:1308683/1‑140 GTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTAT > 1:336402/1‑140 GTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTAT < 2:1610103/140‑1 GAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCG < 1:435978/140‑1 GAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTAT < 2:865632/138‑1 GAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTAT > 1:865632/1‑138 AAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGAGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCA > 2:1092512/1‑140 AGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAG < 2:767608/140‑1 GTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGT < 2:1534959/140‑1 GTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGT < 1:1308683/140‑1 GCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGG > 1:1098634/1‑140 GCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGG > 2:280483/1‑140 GCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCG > 1:318908/1‑133 GCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCG < 2:318908/133‑1 CCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGG < 2:207538/140‑1 TGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTT > 2:561940/1‑140 TGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGG < 2:1517899/140‑1 GATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCA < 2:878550/140‑1 GATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCA > 1:371895/1‑140 ATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCG < 2:1326356/140‑1 ATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCG > 1:667170/1‑140 TTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGA > 2:1412982/1‑140 TGCCGGATGCGGCGCTGCCGGGTCTTATGGGGCTTACAGGCCACGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAA < 1:165211/140‑1 CGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAAC > 1:1092230/1‑140 GGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACG < 1:1008392/140‑1 GCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTG > 1:978939/1‑140 GCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTG > 1:481799/1‑140 TCTGCTCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2581544‑2581698‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTG > NC_000913/2581718‑2581850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |