| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,219,328 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (+127/‑269) | ymgF → / → ycgH | inner membrane protein that interacts with cell division proteins/putative transporter component, N‑terminal fragment |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1219328 = | 1 (0.010) | 109 (1.440) | 69/276 | 0.0 | 99.1% | intergenic (+127/‑273) | ymgF/ycgH | inner membrane protein that interacts with cell division proteins/putative transporter component, N‑terminal fragment |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1219332 | 1 (0.010) | 103 (1.360) | 63/276 | 0.1 | 99.0% | intergenic (+131/‑269) | ymgF/ycgH | inner membrane protein that interacts with cell division proteins/putative transporter component, N‑terminal fragment |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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TGATAAATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1219464‑1219328‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > NC_000913/1467910‑1468047 TGATAAATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGG > 2:1084315/1‑140 ATAAATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGAT > 2:436820/1‑140 ATAAATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGAT > 2:800570/1‑140 ATAAATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGAT > 1:33526/1‑140 TAAATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATT > 1:175951/1‑140 AAATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTT < 1:539252/140‑1 AATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTG < 1:800570/140‑1 ATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGC < 2:561658/140‑1 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ATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:355871/140‑1 ATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:143406/140‑1 TCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATAT > 1:93412/1‑134 TCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATAT < 2:93412/134‑1 CATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 2:33442/140‑1 CATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 2:582780/140‑1 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ATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC < 2:1281222/140‑1 AGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCAT < 2:285127/140‑1 TGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC > 2:1224598/1‑135 TGCGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC < 1:1224598/135‑1 CGATGAGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTT > 2:882684/1‑140 AGGATTATTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAAT > 1:466538/1‑140 TTTCGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAA < 2:1247214/140‑1 CGGTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC < 1:897607/140‑1 GTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCT > 2:114402/1‑140 GTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCT < 1:842991/140‑1 GTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCT > 1:173600/1‑140 GTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCT > 2:415579/1‑140 GTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC > 1:732409/1‑138 GTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC > 1:68649/1‑138 GTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC < 2:732409/138‑1 GTGATATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC < 2:68649/138‑1 TATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC > 2:485589/1‑140 TATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC > 1:31704/1‑140 ATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA < 1:964903/140‑1 ATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA < 2:176522/140‑1 TGATAAATAAGTCGGCATTATCATTTTTCACCTTATTTTCATGACATTGATCACTTTGAGGTGACGATTTTGTTTAACAAATAACTCTTCGACATCAAAATTGTTAATAGTTGCGATGAGGATTATTTCGGTGATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1219464‑1219328‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > NC_000913/1467910‑1468047 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |