| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,466,591 | Δ11 bp | pseudogene (1200‑1210/2518 nt) | ydbA → | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1466590 | 0 (0.000) | 60 (0.960) | 48/274 | 0.2 | 100% | pseudogene (1199/2518 nt) | ydbA | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| ? | NC_000913 | 1466602 = | 0 (0.000) | pseudogene (1211/2518 nt) | ydbA | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment | |||||
AGCGGCGGCGGTCACGGTATTGATATCACCGGCGACAGCGCAACGGTGGATAACAAGGGCACCATGACCGTCACCGATCCGGAGTCCATCGGTATCCAGGTTGACGGCGACCAGGCGGTTGTTAACAACGAAGGCGAGAGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGCAATAACGGGAAGGTGATTCAGGAC > NC_000913/1466463‑1466741 | atctggatgtcagcggcggcggtcacggtattgatatcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcgccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaag < 1:207055‑M2/1‑1 (MQ=255) ctggatgtcagcggcggcggtcacggtattgatatcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaagcg < 2:475420‑M2/3‑1 (MQ=255) ggatgtcagcggcggcggtcacggtattgatatcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGcc < 2:673367‑M2/5‑1 (MQ=255) atgtcagcggcggcggtcacggtattgatatcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCAt < 2:841357‑M2/7‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tattgatatcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACg < 1:1012713‑M2/29‑1 (MQ=255) gatatcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACg > 2:331714‑M2/108‑136 (MQ=255) gatatcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACg < 1:331714‑M2/29‑1 (MQ=255) tatcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGAtt < 1:1036336‑M2/35‑1 (MQ=255) tcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACg > 2:172077‑M2/104‑132 (MQ=255) tcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACg > 2:53156‑M2/104‑132 (MQ=255) tcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACg < 1:53156‑M2/29‑1 (MQ=255) tcaccggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACg < 1:172077‑M2/29‑1 (MQ=255) cggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTaa < 2:670845‑M2/37‑1 (MQ=255) cggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTaa > 1:670845‑M2/100‑136 (MQ=255) cggcgacagcgcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGt > 1:819285‑M2/100‑140 (MQ=255) gcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCa < 1:1057544‑M2/51‑1 (MQ=255) gcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCa < 2:819285‑M2/51‑1 (MQ=255) gcaacggtggataacaagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCa < 1:822770‑M2/51‑1 (MQ=255) aagggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACg < 2:362768‑M2/66‑1 (MQ=255) agggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACgg < 2:831393‑M2/67‑1 (MQ=255) gggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCa > 2:226357‑M2/73‑123 (MQ=255) gggcaccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCa < 1:226357‑M2/51‑1 (MQ=255) caccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCaa < 2:710637‑M2/70‑1 (MQ=255) caccatgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCaa > 1:710637‑M2/70‑139 (MQ=255) atgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAacca > 1:924882‑M2/66‑140 (MQ=255) tgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAaacaacaac > 2:406574‑M2/65‑129 (MQ=255) tgaccgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAaacaacaac < 1:406574‑M2/65‑1 (MQ=255) accgtcaccgatccggagtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCg < 2:397692‑M2/78‑1 (MQ=255) 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2:751851‑M2/90‑1 (MQ=255) gtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGc > 2:736193‑M2/46‑131 (MQ=255) gtccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGc < 1:736193‑M2/86‑1 (MQ=255) ccatcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCAc < 2:245201‑M2/97‑1 (MQ=255) catcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCAcc > 2:534558‑M2/43‑140 (MQ=255) atcggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCg > 2:925912‑M2/42‑140 (MQ=255) cggtatccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGt < 1:96033‑M2/101‑1 (MQ=255) tccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTAcggg > 2:331844‑M2/35‑139 (MQ=255) tccaggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGa > 1:300005‑M2/35‑140 (MQ=255) caggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGaaa < 1:584621‑M2/108‑1 (MQ=255) caggttgacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGaaa > 2:584621‑M2/33‑140 (MQ=255) gacggcgaccaggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTg > 1:716900‑M2/27‑140 (MQ=255) 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1:798175‑M2/124‑1 (MQ=255) ggcggttgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGCAATAACggg > 1:670321‑M2/16‑140 (MQ=255) tgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGc < 1:255474‑M2/116‑1 (MQ=255) tgttaacaaGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGc > 2:255474‑M2/10‑125 (MQ=255) gcgcCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACTGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGCAATAACGGGAAGGTGATTCAGGAc > 1:923289/1‑140 (MQ=255) gcgcCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGCAATAACGGGAAGGTGATTCAGGa < 1:539785/139‑1 (MQ=255) gcgcCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGCAATAACGGGAAGGTGATTCAGGa > 2:539785/1‑139 (MQ=255) gcgcCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGCAATAACGGGAAGGTGATTCAGGAc > 1:436953/1‑140 (MQ=255) gcgcCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGCAATAACGGGAAGGTGATTCAGGAc > 2:16/1‑140 (MQ=255) | AGCGGCGGCGGTCACGGTATTGATATCACCGGCGACAGCGCAACGGTGGATAACAAGGGCACCATGACCGTCACCGATCCGGAGTCCATCGGTATCCAGGTTGACGGCGACCAGGCGGTTGTTAACAACGAAGGCGAGAGCGCCATCACCAACGGTGGCACCGGCACGCAGATTAACGGTGATGACGCCACGGCAAACAACAACGGCAAAACCACCGTTGACGGCAAGGATTCCACCGGTACGGAAATTGCTGGCAATAACGGGAAGGTGATTCAGGAC > NC_000913/1466463‑1466741 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |