| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3427037 | 0 (0.000) | 22 (0.830) +TGGGATCAACACTCATGTGTTGATAA |
11/224 | 1.0 | 100% | intergenic (‑4/+39) | alaU/ileU | tRNA‑Ala/tRNA‑Ile |
| ? | NC_000913 | 3427076 = | NA (NA) | noncoding (77/77 nt) | ileU | tRNA‑Ile | |||||
GATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3426956‑3427037‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTAC > NC_000913/3427076‑3427146 |||||||||||||||||||||||||| acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCAC < 1:192543/130‑1acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCAC > 2:192543/6‑135 aaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCA < 1:11709/138‑1 ttGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:1116214/138‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 1:1104791/140‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:771158/140‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:556350/140‑1 agccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTT > 2:378835/7‑140 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTA > 1:1058953/6‑140 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA < 1:361768/138‑1 GCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGG > 2:189072/1‑140 CGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 1:987845/130‑1 CGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC > 2:987845/1‑130 GGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT > 2:878192/1‑140 GATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTG > 1:839212/1‑140 TCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCG < 2:19149/140‑1 TCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCG < 2:839212/140‑1 gctGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAAC < 2:23345/137‑1 gctGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAAC < 1:347067/137‑1 ctGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACC > 2:548968/3‑140 CTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTG > 2:1080798/1‑140 ctTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGAGCTAa > 1:603207/3‑139 |||||||||||||||||||||||||| GATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3426956‑3427037‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTAC > NC_000913/3427076‑3427146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |