Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 4,037,218 | 42 bp→TTATCAACACATGAGTGTTGATCCCAATAC | intergenic (+1/‑1) | ileT → / → alaT | tRNA‑Ile/tRNA‑Ala |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4037217 | 2 (0.060) | 20 (0.780) +TTATCAACACATGAGTGTTGATCCCAATAC |
10/216 | 1.1 | 96.2% | noncoding (77/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile |
? | NC_000913 | 4037260 = | 0 (0.000) | noncoding (1/76 nt) | alaT | tRNA‑Ala |
GGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCT > NC_000913/4037155‑4037338 | gcctttagctcagctggttagagcacacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTg < 2:202297‑M2/35‑1 (MQ=255) tttagctcagctggttagagcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGcaa > 1:1192624‑M2/103‑139 (MQ=255) ttagctcagctggttagagcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTgcaag > 1:1001111‑M2/102‑138 (MQ=255) gagcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGtt < 1:193817‑M2/55‑1 (MQ=255) cgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGa < 1:241233‑M2/58‑1 (MQ=255) gcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGAt < 2:240913‑M2/59‑1 (MQ=255) acccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATcc > 2:1179866‑M2/80‑140 (MQ=255) acccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATcc > 1:619772‑M2/80‑140 (MQ=255) cctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGc < 2:414813‑M2/64‑1 (MQ=255) ctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCgct < 2:834224‑M2/65‑2 (MQ=255) taagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGAtcccgcttggc < 2:1001111‑M2/69‑6 (MQ=255) ggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTcca > 2:553503‑M2/68‑140 (MQ=255) ggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTcca > 2:626168‑M2/68‑140 (MQ=255) ggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTcca > 2:777186‑M2/68‑140 (MQ=255) tgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGctccatt > 1:998237‑M2/66‑138 (MQ=255) tgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGctccatt > 1:1195724‑M2/66‑138 (MQ=255) ggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTtggctccatttgt > 1:797699‑M2/63‑135 (MQ=255) ggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTtggctccatttgt > 2:984878‑M2/63‑135 (MQ=255) gtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCttggctccatttgtt < 1:566582‑M2/79‑7 (MQ=255) gtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaatacGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCttggctccatttgtt > 2:566582‑M2/62‑134 (MQ=255) | GGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCT > NC_000913/4037155‑4037338 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |