| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 438,018 | Δ17 bp | coding (102‑118/975 nt) | yajO ← | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase YajO |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 438035 = | 0 (0.000) | coding (101/975 nt) | yajO | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase YajO | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CAACGACCACGTCTTCACGACGGGCGAAATCCCGCAGTGCGCGACCGACGATCTCTTCGCTGCTGCCGTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTC > NC_000913/437880‑438156 | cAACGACCACGTCTTCACGACGGGCGAAATCCCGCAGTGCGCGACCGACGATCTCTTCGCTGCTGCCGTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCgt < 2:938352‑M1/140‑3 (MQ=255) aaCGACCACGTCTTCACGACGGGCGAAATCCCGCAGTGCGCGACCGACGATCTCTTCGCTGCTGCCGTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCgtc < 1:1241306‑M1/140‑4 (MQ=255) aCGACCACGTCTTCACGACGGGCGAAATCCCGCAGTGCGCGACCGACGATCTCTTCGCTGCTGCCGTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCgtcc > 2:1057994‑M1/1‑136 (MQ=255) aCGACCACGTCTTCACGACGGGCGAAATCCCGCAGTGCGCGACCGACGATCTCTTCGCTGCTGCCGTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCgtcc > 1:943610‑M1/1‑136 (MQ=255) 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2:658259‑M1/1‑1 (MQ=255) | CAACGACCACGTCTTCACGACGGGCGAAATCCCGCAGTGCGCGACCGACGATCTCTTCGCTGCTGCCGTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTC > NC_000913/437880‑438156 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |