| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 438,018 | Δ17 bp | coding (102‑118/975 nt) | yajO ← | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase YajO |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 438035 = | 0 (0.000) | coding (101/975 nt) | yajO | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase YajO | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CGACGGGCGAAATCCCGCAGTGCGCGACCGACGATCTCTTCGCTGCTGCCGTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGC > NC_000913/437897‑438173 | caacgaccacgtcttcacgacgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGt < 2:938352‑M2/2‑1 (MQ=255) aacgaccacgtcttcacgacgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTc < 1:1241306‑M2/3‑1 (MQ=255) acgaccacgtcttcacgacgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTcc > 2:1057994‑M2/137‑140 (MQ=255) acgaccacgtcttcacgacgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTcc > 1:943610‑M2/137‑140 (MQ=255) acgaccacgtcttcacgacgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTcc > 1:79498‑M2/137‑140 (MQ=255) cgaccacgtcttcacgacgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCa < 1:1080624‑M2/5‑1 (MQ=255) accacgtcttcacgacgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATg < 1:729201‑M2/7‑1 (MQ=255) acgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGa > 1:1033696‑M2/120‑140 (MQ=255) cgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGAt > 1:115789‑M2/119‑140 (MQ=255) cgggcgaaatcccgcagtgcgcgaccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGAt > 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ccgacgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGc < 1:398404‑M2/46‑1 (MQ=255) acgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGa > 2:1116517‑M2/92‑140 (MQ=255) acgatctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGa > 1:763163‑M2/92‑140 (MQ=255) tctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTGCCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCa < 2:1217318‑M2/53‑1 (MQ=255) tctcttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCa < 2:480144‑M2/53‑1 (MQ=255) cttcgctgctgccgtcagaataactgttggcggtatcaaagaaatttatgccgccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAg > 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2:551178‑M2/109‑1 (MQ=255) ccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCAc < 1:1122780‑M2/109‑1 (MQ=255) ccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCAc < 2:1216016‑M2/109‑1 (MQ=255) ccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCAc < 1:1160179‑M2/109‑1 (MQ=255) ccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCAc < 1:365947‑M2/109‑1 (MQ=255) ccttccagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCAc < 1:483548‑M2/109‑1 (MQ=255) cagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTg > 2:708781‑M2/27‑140 (MQ=255) cagtgcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTg < 1:657895‑M2/114‑1 (MQ=255) gcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCtat < 2:765540‑M2/118‑1 (MQ=255) gcacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCtat < 1:1186875‑M2/118‑1 (MQ=255) cacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTcc > 2:747275‑M2/22‑133 (MQ=255) cacgtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCtata > 2:611427‑M2/22‑140 (MQ=255) gtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAtgctgc < 2:1043499‑M2/106‑1 (MQ=255) gtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAtgctgc > 1:1043499‑M2/19‑124 (MQ=255) gtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTc > 2:545287‑M2/19‑140 (MQ=255) gtttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTc > 1:710414‑M2/19‑140 (MQ=255) ttaattatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAtgctgc > 2:822052‑M2/17‑122 (MQ=255) attatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCAt > 2:1033499‑M2/14‑140 (MQ=255) tatgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATAc > 1:251789‑M2/12‑140 (MQ=255) tgggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACtt > 1:1195197‑M2/10‑140 (MQ=255) gggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGt > 1:627129‑M2/9‑132 (MQ=255) gggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTc > 2:301757‑M2/9‑140 (MQ=255) gggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTc > 1:83930‑M2/9‑140 (MQ=255) ggacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCa > 2:505895‑M2/8‑140 (MQ=255) gacggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCaa < 1:1056126‑M2/134‑1 (MQ=255) acggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAg < 2:251789‑M2/135‑1 (MQ=255) cggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGt > 2:440109‑M2/5‑140 (MQ=255) cggcGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGt > 2:337150‑M2/5‑140 (MQ=255) cGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGc > 2:658259‑M2/2‑140 (MQ=255) | CGACGGGCGAAATCCCGCAGTGCGCGACCGACGATCTCTTCGCTGCTGCCGTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGC > NC_000913/437897‑438173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |