| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 225500 = | 8 (0.200) | 44 (1.380) +GTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAA |
16/216 | 0.7 | 91.1% | noncoding (1/76 nt) | alaV | tRNA‑Ala |
| ? | NC_000913 | = 4037217 | 3 (0.070) | noncoding (77/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile | |||||
GATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/225577‑225500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTAC < NC_000913/4037217‑4037147 |||||||||||||||||||||||||||||| acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACC > 2:101290/6‑140acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACC > 2:243179/6‑140acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACC > 2:436110/6‑140acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAT‑GGCCCTTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCT < 2:1147873/135‑1 aaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCA < 1:243179/138‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:725310/140‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:529010/140‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 1:1235344/140‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:1209749/140‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 1:101290/140‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACATCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTAACC < 2:1056233/140‑1 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC > 1:202062/6‑136 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:202062/131‑1 ccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTAT < 2:77029/136‑1 aaGCGGGATCGAACCGCTTACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 2:704249/3‑140 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 1:235358/3‑140 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 2:104934/3‑140 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCAC < 2:948940/121‑1 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCAC > 1:948940/3‑123 aaGCGGGATCGAACCACTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 1:888155/3‑140 GCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGG > 2:983467/1‑140 CGGGATCTAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTATCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGG > 1:1186710/1‑140 CGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCTACCTCACCCTTATCAGGG < 1:531534/140‑1 CGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGG < 1:983467/140‑1 GATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTG > 2:1294063/1‑140 GATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTG > 1:384781/1‑140 GATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTC > 1:50965/1‑124 GATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTC < 2:50965/124‑1 tctAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTATCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCG < 2:1186710/137‑1 TCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCG < 1:213827/140‑1 TCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATAAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCG < 2:191391/140‑1 ctGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACC > 1:815255/3‑140 ctGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACC > 1:726719/3‑140 ctGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACC > 2:55879/3‑140 ctGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACC > 1:255996/3‑140 ctGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT > 1:1171190/3‑129 ctGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT < 2:1171190/127‑1 tGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCA > 2:2098445/2‑140 GACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAg > 1:1451511/1‑139 CTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTG < 1:1294063/140‑1 TCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCGCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTAGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGA > 1:1411760/1‑140 TCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGA > 2:19965/1‑140 CTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGAGC > 2:249496/1‑140 ctTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACAACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGAGCTAa > 2:1436364/3‑139 |||||||||||||||||||||||||||||| GATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/225577‑225500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTAC < NC_000913/4037217‑4037147 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |