| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 225500 = | 8 (0.200) | 44 (1.380) +GTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAA |
16/216 | 0.7 | 91.1% | noncoding (1/76 nt) | alaV | tRNA‑Ala |
| ? | NC_000913 | = 4037217 | 3 (0.070) | noncoding (77/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile | |||||
AAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAG > NC_000913/4037078‑4037327 | aagaagCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCa > 2:2199478/1‑140 (MQ=35) cGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTg > 2:1886616/1‑140 (MQ=34) cGTTCTTTGAAGAGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCAGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGACCACAAAGGCCTACCAAATTTg > 2:1668238/1‑140 (MQ=11) ttCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCa > 1:1750365/1‑140 (MQ=34) cctttagctCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgc < 1:1900064‑M2/136‑67 (MQ=255) ctttagcTCAGCTGGTTAGAGAGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgca > 2:373424‑M2/4‑73 (MQ=255) tttagCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaa < 2:1346434‑M2/138‑69 (MQ=255) ttaGCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTTGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaag > 2:1436364‑M2/2‑71 (MQ=255) ttaGCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCGCCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaag < 2:2169636‑M2/139‑70 (MQ=255) ttaGCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaag > 2:1121051‑M2/2‑71 (MQ=255) gCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcag > 2:249496‑M2/1‑68 (MQ=255) tCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCTAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgcgagagcgcctgccttgcaagcagga > 1:1411760‑M2/1‑66 (MQ=255) tCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcagga > 2:19965‑M2/1‑66 (MQ=255) cAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggag < 1:1294063‑M2/140‑76 (MQ=255) agctggttagAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggagg < 2:1384288‑M2/137‑77 (MQ=255) ctggttAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtc > 1:1451511‑M2/2‑62 (MQ=255) tggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtca > 2:2098445‑M2/1‑61 (MQ=255) ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:1372127‑M2/1‑60 (MQ=255) ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:815255‑M2/1‑60 (MQ=255) ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:726719‑M2/1‑60 (MQ=255) ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 2:55879‑M2/1‑60 (MQ=255) ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:255996‑M2/1‑60 (MQ=255) agCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttc < 1:1376237‑M2/140‑87 (MQ=255) cgcACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgtttatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcga < 2:191391‑M2/140‑89 (MQ=255) cgcACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggatagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttaga < 2:1186710‑M2/140‑89 (MQ=255) cgcACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcga < 1:213827‑M2/140‑89 (MQ=255) cgcACCCATGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcga < 1:881194‑M2/140‑89 (MQ=255) gcACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgat > 2:435597‑M2/1‑51 (MQ=255) cACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatc > 1:384781‑M2/1‑50 (MQ=255) cACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatc > 2:1294063‑M2/1‑50 (MQ=255) aCCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:1171190‑M2/1‑49 (MQ=255) aCCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag < 2:1171190‑M2/129‑81 (MQ=255) cccTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggatagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttagatcccg > 1:1186710‑M2/1‑47 (MQ=255) cccTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccg < 1:983467‑M2/140‑94 (MQ=255) cccTGATAAGGGTGAGGTAGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccg < 1:531534‑M2/140‑94 (MQ=255) ccTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgcattgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgc > 1:673176‑M2/1‑46 (MQ=255) ccTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgc > 2:983467‑M2/1‑46 (MQ=255) tGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagtggttcgatcccgctt > 1:888155‑M2/1‑44 (MQ=255) tGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgctt > 1:235358‑M2/1‑44 (MQ=255) tGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgctt > 2:104934‑M2/1‑44 (MQ=255) tGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtaagcggttcgatcccgctt > 2:704249‑M2/1‑44 (MQ=255) aTAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttgg < 1:540404‑M2/140‑99 (MQ=255) aTAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttgg < 2:77029‑M2/140‑99 (MQ=255) tAATGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggatgtcagcggttcgatcccgcttggc > 2:396223‑M2/1‑41 (MQ=255) tAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggc > 2:110482‑M2/1‑41 (MQ=255) ggTTAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggatgtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:1056233‑M2/140‑104 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggatagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:922173‑M2/140‑104 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 1:524313‑M2/140‑104 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcc < 1:533366‑M2/128‑92 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcc > 2:533366‑M2/1‑37 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:725310‑M2/140‑104 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:1209749‑M2/140‑104 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:529010‑M2/140‑104 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 1:101290‑M2/140‑104 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 1:1235344‑M2/140‑104 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggc > 1:202062‑M2/1‑37 (MQ=255) ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggc < 2:202062‑M2/136‑100 (MQ=255) tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatt < 1:1444867‑M2/140‑106 (MQ=255) tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatt < 2:283561‑M2/140‑106 (MQ=255) tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatt < 2:508768‑M2/140‑106 (MQ=255) tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttagatcccgcttggctccatt < 2:36239‑M2/140‑106 (MQ=255) tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatt < 1:243179‑M2/140‑106 (MQ=255) gAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatc < 2:50965‑M2/124‑91 (MQ=255) gAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatc > 1:50965‑M2/1‑34 (MQ=255) aGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttg < 2:1549939‑M2/140‑108 (MQ=255) aGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaataagggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt < 2:1147873‑M2/140‑108 (MQ=255) ggTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt < 2:1114860‑M2/140‑109 (MQ=255) ggTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt > 2:436110‑M2/1‑32 (MQ=255) ggTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt > 2:243179‑M2/1‑32 (MQ=255) ggTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt > 2:101290‑M2/1‑32 (MQ=255) tCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgttc > 1:1159044‑M2/1‑30 (MQ=255) gtggtTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgctt > 1:948940‑M2/1‑27 (MQ=255) gtggtTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgctt < 2:948940‑M2/123‑97 (MQ=255) | AAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAG > NC_000913/4037078‑4037327 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |