| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 225496 = | 7 (0.170) | 25 (0.760) +TGGGATCAACACTCATGTGTTGATAA |
11/224 | 1.4 | 86.1% | intergenic (+39/‑4) | ileV/alaV | tRNA‑Ile/tRNA‑Ala |
| ? | NC_000913 | = 4037217 | 3 (0.070) | noncoding (77/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile | |||||
GTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGGTTAAATAAAAAATACTTCAGAGTGTACCTGCAAAGGTTCACTGCG > NC_000913/225396‑225632 | cctttagctcagctggttagagcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGc < 1:1900064‑M1/40‑1 (MQ=255) ctttagctcagctggttagagagcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCa > 2:373424‑M1/100‑140 (MQ=255) tttagctcagctggttagagcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGcaa < 2:1346434‑M1/42‑2 (MQ=255) ttagctcagctggttagagcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccgccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTgcaag < 2:2169636‑M1/43‑3 (MQ=255) ttagctcagctggttagagcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTgcaag > 2:1121051‑M1/98‑138 (MQ=255) agctggttagagcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCaggagg < 2:1384288‑M1/50‑1 (MQ=255) ggttagagcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGgtcag > 1:1372127‑M1/87‑138 (MQ=255) agcgcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTc < 1:1376237‑M1/60‑1 (MQ=255) cgcacccatgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGa < 1:881194‑M1/62‑1 (MQ=255) gcacccctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGAt > 2:435597‑M1/78‑140 (MQ=255) cctgataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGc > 1:673176‑M1/73‑140 (MQ=255) ataagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATcccgcttgg < 1:540404‑M1/72‑5 (MQ=255) taatggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGATGTCAGCGGTTCGAtcccgcttggc > 2:396223‑M1/68‑135 (MQ=255) taagggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGAtcccgcttggc > 2:110482‑M1/68‑135 (MQ=255) ggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGATAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTcca < 2:922173‑M1/77‑1 (MQ=255) ggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATcc < 1:533366‑M1/65‑1 (MQ=255) ggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATcc > 2:533366‑M1/64‑128 (MQ=255) ggtgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTcca < 1:524313‑M1/77‑1 (MQ=255) tgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGctccatt < 2:508768‑M1/79‑3 (MQ=255) tgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGctccatt < 1:1444867‑M1/79‑3 (MQ=255) tgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGctccatt < 2:283561‑M1/79‑3 (MQ=255) tgaggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTAGATCCCGCTTGGctccatt < 2:36239‑M1/79‑3 (MQ=255) aggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTggctccatttg < 2:1549939‑M1/81‑5 (MQ=255) ggtcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTtggctccatttgt < 2:1114860‑M1/82‑6 (MQ=255) tcggtggttcgagtccactaaggcccaccattatcaacacatgagtgttgatcccaTTAAGGGGCCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCCTTGCAAGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGcttggctccatttgttc > 1:1159044‑M1/57‑133 (MQ=255) gCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGTACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGGtt > 1:1830812/1‑140 (MQ=17) aTTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGGTTAAATaaaaa < 1:1810169/140‑1 (MQ=33) aCGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGGTTAAATAAAAAATACtt < 1:2316965/140‑1 (MQ=33) gTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGGTTAAATAAAAAATACTTCAGAGTGTACCTGCaaa > 1:1689869/1‑140 (MQ=32) tAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGGTTAAATAAAAAATTCTTCAGAGTGTACCTGCAAAGGtt < 1:1611121/140‑1 (MQ=17) aTGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCCCCATCTCTGTAGTGGTTAAATAAAAAATACTTCAGAGTGTACCTGCAAAGGTTCACTGCg < 2:1897241/140‑1 (MQ=17) aTGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGGTTAAATAAAAAATACTTCAGAGTGTACCTGCAAAGGTTCACTGCg < 2:2161450/140‑1 (MQ=33) | GTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGGTTAAATAAAAAATACTTCAGAGTGTACCTGCAAAGGTTCACTGCG > NC_000913/225396‑225632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |