New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4180665 = | 150 (1.150) | 5 (0.040) | 5/256 | 7.6 | 3.4% | coding (106/366 nt) | rplL | 50S ribosomal subunit protein L12 |
? | NC_000913 | = 4180661 | 144 (1.190) | coding (102/366 nt) | rplL | 50S ribosomal subunit protein L12 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TATAAACTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCTGGGTCTGAA > NC_000913/4180526‑4180804 | tataAACTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctg > 1:1536579/1‑140 (MQ=255) aCTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgct < 1:1927418/140‑1 (MQ=255) tATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgct < 1:1490764/140‑1 (MQ=255) aTTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGctgctgctgctg > 2:1285078/1‑140 (MQ=255) aTTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGctgctgctgctg > 1:643873/1‑140 (MQ=255) aTTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGctgctgctgctg > 2:1781294/1‑140 (MQ=255) atatTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTgctgtagctg > 1:366010/1‑140 (MQ=255) atatTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTgctgtagctg > 1:1410835/1‑140 (MQ=255) aGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGtagctgtagctg > 1:1079849/1‑140 (MQ=255) aGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGtagctgtagctg > 1:287118/1‑140 (MQ=255) aGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGtagctgtagctg > 1:1788643/1‑140 (MQ=255) cAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGc < 2:1016704/140‑1 (MQ=255) aTTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGccc > 2:1932671/1‑140 (MQ=255) aTTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGccc > 2:2017565/1‑140 (MQ=255) aTTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGc > 1:920694/1‑138 (MQ=255) aTTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGc < 2:920694/138‑1 (MQ=255) tttAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGc < 1:1802863/137‑1 (MQ=255) tttAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCg < 2:287118/140‑1 (MQ=255) tttAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCg > 2:969051/1‑140 (MQ=255) tCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAgc > 2:939543/1‑140 (MQ=255) tCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAgc > 1:1847476/1‑140 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAgctg < 2:413460/140‑1 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAgctg > 1:783592/1‑140 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAgctg > 1:1960751/1‑140 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAgctg > 2:278461/1‑140 (MQ=255) aCTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTga < 1:2017565/140‑1 (MQ=255) tCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGaaaaaa > 2:857238/1‑140 (MQ=255) cAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAAc > 1:1919765/1‑140 (MQ=255) aaaTCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACt < 2:1496605/140‑1 (MQ=255) aaTCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTg > 1:1793308/1‑140 (MQ=255) aaTCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTg > 1:451556/1‑140 (MQ=255) ttGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTc > 1:1492725/1‑140 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCg > 2:912455/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAAtt > 1:1322673/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCC‑‑‑GCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTg > 2:1452291/1‑140 (MQ=255) tCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAgctgc > 1:97917/1‑140 (MQ=255) aaTGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGgcg > 1:1824102/1‑140 (MQ=255) aaTGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGgcg < 2:1847476/140‑1 (MQ=255) tGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCt < 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cTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGt < 1:278461/140‑1 (MQ=255) gATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTa > 1:296951/1‑140 (MQ=255) aTCTCTGCAATGGAAGAAAAATTTGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTAt < 2:1881539/140‑1 (MQ=255) aTCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGgcgc > 2:2179489/1‑122 (MQ=255) aTCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGgcgc < 1:2179489/122‑1 (MQ=255) aTCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAg > 1:434343/1‑130 (MQ=255) 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(MQ=255) aaaaTTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGgcg < 1:1133685/140‑1 (MQ=255) aTTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGTATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCCGTAGGTGGCGCaa < 2:1536579/140‑1 (MQ=255) aTTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCaa < 2:1283008/140‑1 (MQ=255) aTTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCaa < 1:25480/140‑1 (MQ=255) tgtTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGcc > 1:1571444/1‑140 (MQ=255) tgtTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGcc < 1:912455/140‑1 (MQ=255) tgtTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGcc < 1:809025/140‑1 (MQ=255) tgtTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGcc < 1:1947105/140‑1 (MQ=255) gtTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCt < 2:1113035/140‑1 (MQ=255) gtTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCt < 2:751718/140‑1 (MQ=255) gtTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCt < 2:1861627/140‑1 (MQ=255) gtTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCt < 1:1285078/140‑1 (MQ=255) gtTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCt < 1:1738092/140‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCTGGGt < 2:591709/140‑1 (MQ=255) | TATAAACTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCTGGGTCTGAA > NC_000913/4180526‑4180804 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |