| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,587,854 | Δ12 bp | coding (432‑443/504 nt) | ydeR ← | putative fimbrial protein YdeR |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 1587854 | 1587865 | 12 | 96 [0] | [0] 96 | ydeR | putative fimbrial protein YdeR |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1587853 | 0 (0.000) | 96 (1.000) | 53/274 | 0.4 | 100% | coding (444/504 nt) | ydeR | putative fimbrial protein YdeR |
| ? | NC_000913 | 1587866 = | 0 (0.000) | coding (431/504 nt) | ydeR | putative fimbrial protein YdeR | |||||
CTGATTGTTTTACCCATGATATATCCTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTAGATCACATTGATTAGCGCCTCGATCGTTCCCTGGCTTGCGTTTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1587718‑1587853‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTACCTTCATTTTT > NC_000913/1587866‑1588002 CTGATTGTTTTACCCATGATATATCCTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTAGATCACATTGATTAGCGCCTCGATCGTTCCCTGGCTTGCGTTTCCAGCTC > 1:2212627/1‑140 TGATTGTTTTACCCATGATATATCCTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTAGATCACATTGATTAGCGCCTCGATCGTTCCCTGGCTTGCGTTTCCAGCTCT > 2:1122140/1‑140 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GCCTCGATCGTTCCCTGGCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTG > 1:2302048/1‑140 CCTCGATCGTTCCCTGGCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGA < 2:1928697/140‑1 CGATCGTTCCCTGGCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATA > 1:1326580/1‑140 CGATCGTTCCCTGGCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATA > 2:1375311/1‑140 GTTCCCTGGCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTC > 2:2031276/1‑140 TTCCCTGGCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCCATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCG > 2:2574163/1‑140 CCTGGCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCA < 2:1351775/140‑1 CCTGGCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCACATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCA < 2:1433045/140‑1 GCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTAC < 2:1491363/140‑1 GCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTAC > 2:1128357/1‑140 GCTTGCGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGAGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTAC < 1:2562526/140‑1 CGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTACCTTCA < 1:1647653/140‑1 CGTTTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTACCTTCA > 2:1152692/1‑140 TTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTACCTTCATTT < 2:1076352/140‑1 TTCCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTACCTTCATTT < 2:2486635/140‑1 CCAGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTACCTTCATTTTT > 1:2046860/1‑140 CTGATTGTTTTACCCATGATATATCCTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTAGATCACATTGATTAGCGCCTCGATCGTTCCCTGGCTTGCGTTTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1587718‑1587853‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGCTCTTGCCTTAAGTGGAAACTGTGCATTACGAGTGATCTCATCAACAATAACCGTTTTGCTATCGCCATTTTTTAACGCAGCATCCTGGTCATCCCTCAGCTCTATCTGAATATTTTCGGCAGTACCTTCATTTTT > NC_000913/1587866‑1588002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |