New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
GATATCACTGGCAAACACTTTCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAATCCGTCAG > NC_000913/1968900‑1969178 | gATATCACTGGCAAACACTTTCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGAcgtgcgt < 1:273567/140‑1 (MQ=255) tacggctcttcgccggtcgaagccgccgcgctccatacgcgatactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCcg < 2:564640‑M1/7‑1 (MQ=255) aCTGGCAAACACTTTCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCcg < 1:1271235/140‑1 (MQ=255) cTGGCAAACACTTTCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCcgc < 1:427791/140‑1 (MQ=255) acggctcttcgccggtcgaagccgccgcgctccatacgcgatactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCcgc > 2:96689‑M1/133‑140 (MQ=255) ggCAAACACTTTCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGa > 1:947206/1‑140 (MQ=255) gctcttcgccggtcgaagccgccgcgctccatacgcgatactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAg > 2:834320‑M1/130‑140 (MQ=255) gctcttcgccggtcgaagccgccgcgctccatacgcgatactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAg > 2:813692‑M1/130‑140 (MQ=255) gctcttcgccggtcgaagccgccgcgctccatacgcgatactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAg > 1:444279‑M1/130‑140 (MQ=255) gCAAACACTTTCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAg < 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tcttcgccggtcgaagccgccgcgctccatacgcgatactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCa > 2:809026‑M1/128‑140 (MQ=255) aaaCACTTTCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCa > 1:142262/1‑140 (MQ=255) cttcgccggtcgaagccgccgcgctccatacgcgatactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCcg > 1:134015‑M1/127‑133 (MQ=255) cttcgccggtcgaagccgccgcgctccatacgcgatactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCcg < 2:134015‑M1/7‑1 (MQ=255) acacTTTCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCaga < 2:1123688/140‑1 (MQ=255) cTTTCCAGCGTCCGGGTGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAggg < 2:715981/140‑1 (MQ=255) ccggtcgaagccgccgcgctccatacgcgagactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGa > 2:883772‑M1/122‑140 (MQ=255) ttCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGaa < 2:623867/140‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGaaa > 2:530425/1‑140 (MQ=255) tCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGaaa > 1:809026/1‑140 (MQ=255) tCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGaaa > 1:866806/1‑140 (MQ=255) gtcgaagccgccgcgctccatacgcgatactcgccagaacggcgacgtgcgtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAat < 1:578741‑M1/22‑1 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gccgcGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcct > 2:1256422‑M2/1‑109 (MQ=255) tgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGa < 1:58974‑M1/99‑1 (MQ=255) cctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAtt < 2:241508‑M1/101‑1 (MQ=255) cctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAtt < 2:1249397‑M1/101‑1 (MQ=255) gcgATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaacatgcc < 2:57792‑M2/140‑46 (MQ=255) gcgATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgcc < 1:599044‑M2/140‑46 (MQ=255) aatgccgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCa > 1:1129123‑M1/29‑140 (MQ=255) cgtcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTc > 2:1028012‑M1/24‑140 (MQ=255) tcagattcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAg < 2:135767‑M1/119‑1 (MQ=255) tCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagat < 1:104332‑M2/140‑53 (MQ=255) gCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAAGGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattc > 2:794212‑M2/1‑86 (MQ=255) attcgtggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATaa > 1:775517‑M1/18‑140 (MQ=255) aGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtg < 2:636379‑M2/140‑58 (MQ=255) gAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtgg > 1:1056408‑M2/1‑82 (MQ=255) aaCGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggt < 2:1215991‑M2/140‑60 (MQ=255) aaCGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAA‑TGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtc > 1:237695‑M2/1‑80 (MQ=255) tggtcagcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGAcc < 1:378506‑M1/128‑1 (MQ=255) cGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtca > 2:630978‑M2/1‑79 (MQ=255) agcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAAt < 2:742455‑M1/133‑1 (MQ=255) agcgaatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAAt < 1:101729‑M1/133‑1 (MQ=255) tgcgtgATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaattg < 1:1291204‑M2/140‑70 (MQ=255) aatTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAATCCGt > 1:241508‑M1/4‑140 (MQ=255) tgATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaattgataa < 2:808583‑M2/140‑74 (MQ=255) | GATATCACTGGCAAACACTTTCCAGCGTCCGGGCGCGGTGCCCAATGTGTCAGCCAGCGTCATCGCAATGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAATCCGTCAG > NC_000913/1968900‑1969178 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |