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Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
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cGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAATCCGTCAGTCCCAGCGAACGCAAACGACGAACCAGTCGGTTGTAAACCATGTCGCGTTTATGGTCAGCCa > 1:917341/1‑140 (MQ=255) cGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAATCCGTCAGTCCCAGCGAACGCAAACGACGAACCAGTCGGTTGTAAACCATGTCGCGTTTATGGTCAGCCa > 1:569125/1‑140 (MQ=255) gAATtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaattgataaacgcctgccactcaccgctgtgctgattagattccagcaagttcagataatgaccgaaatccg > 2:1267538‑M2/1‑4 (MQ=255) aaTtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaattgataaacgcctgccactcaccgctgtgctgattagattccagcaagttcagataatgaccgaaatccgt > 2:1194425‑M2/1‑3 (MQ=255) aaTTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAATCCGTCAGTCCCAGCGAACGCAAACGACGAACCAGTCGGTTGTAAACCATGTCGCGTTTATGGTCAGCCAGa > 2:27024/1‑140 (MQ=255) aTtgatccgcgagcagagggaaatgatgtgcctcacggaaaaatgccgtcagattcgtggtcagcgaattgataaacgcctgccactcaccgctgtgctgattagattccagcaagttcagataatgaccgaaatccgtc < 1:1292148‑M2/140‑139 (MQ=255) aTTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAATCCGTCAGTCCCAGCGAACGCAAACGACGAACCAGTCGGTTGTAAACCATGTCGCGTTTATGGTCAGCCAGaa > 2:179531/1‑140 (MQ=255) aTTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAATCCGTCAGTCCCAGCGAACGCAAACGACGAACCAGTCGGTTGTAAACCATGTCGCGTTTATGGTCAGCCAGaa < 1:1160152/140‑1 (MQ=255) | TGCTGTACGGCTCTTCGCCGGTCGAAGCCGCCGCGCTCCATACGCGATACTCGCCAGAACGGCGACGTGCGTGATCCGCGAGCAGAGGGAAATGATGTGCCTCACGGAAAAATGCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGCAAGTTCAGATAATGACCGAAATCCGTCAGTCCCAGCGAACGCAAACGACGAACCAGTCGGTTGTAAACCATGTCGCGTTTATGGTCAGCCAGAA > NC_000913/1968968‑1969243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |