New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1590765 = | 0 (0.000) | 1257 (32.560) | 178/266 | 0.0 | 99.4% | intergenic (‑229/+89) | yneL/hipA | putative HTH‑type transcriptional regulator YneL/serine/threonine kinase HipA |
? | NC_000913 | = 1647024 | 15 (0.390) | intergenic (+287/+150) | flxA/ydfW | Qin prophage; protein FlxA/Qin prophage; uncharacterized protein YdfW |
Only 100 of 1287 total aligned reads displayed.
AGCAATGTGTTGAGGTTGCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1590907‑1590765 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taatgAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGTCAGTTAAACTC < NC_000913/1647024‑1646886 aatctaTTGAGGTTGCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTTAGTGAGATATGGGGTTTTGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGAGTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATG < 2:658115/134‑1 TGTGTTGAGGTTGCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAG > 1:173613/1‑140 GTTGAGGTTGCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCG < 1:578659/140‑1 GTTGAGGTTGCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCG < 1:307208/140‑1 AGGTTGCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTAT > 2:535985/1‑140 GCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAA > 1:548447/1‑140 GCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAA > 2:487082/1‑140 GCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAA > 2:497342/1‑140 GCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAA > 2:555011/1‑140 CATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAA < 1:651919/140‑1 CATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTAT > 2:207329/1‑134 ATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAA > 1:518296/1‑138 ATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGGTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAAT > 2:431925/1‑140 GACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGC < 2:213403/140‑1 CGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCT < 1:370907/140‑1 TAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGC > 2:57555/1‑140 TAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGC > 2:526223/1‑140 AATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCG > 2:127316/1‑140 AATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCG > 1:478312/1‑140 AATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCG < 2:251653/140‑1 AATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGC < 1:220291/125‑1 ACGGTAGTAAGTGAGATATAGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTA < 1:491126/140‑1 CGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAA > 1:68641/1‑130 TAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAA > 1:353847/1‑140 AGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGA > 1:92566/1‑140 AGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGA > 2:266345/1‑140 GTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAA > 1:5917/1‑140 TGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAG < 1:241514/140‑1 TGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAG < 1:528798/140‑1 AGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCG > 2:91142/1‑140 GATATGGGGTTTGGCCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGG > 2:81431/1‑140 ATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAG > 1:40581/1‑140 GGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAG < 1:659111/131‑1 GGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGG > 2:412489/1‑140 GGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCACATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGG < 2:441747/140‑1 TTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCA < 1:125262/140‑1 TTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCA > 2:360115/1‑140 TGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGT > 2:380681/1‑140 TGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGT > 2:233875/1‑140 TGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGT > 1:623245/1‑140 TGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGT > 2:597386/1‑140 GGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGG‑AGTTGGCAGTTT > 1:100662/1‑140 TCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTT > 1:44167/1‑140 TGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGG > 2:226600/1‑140 TGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGG > 1:634013/1‑140 GTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGA < 1:266345/140‑1 TTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGAC < 2:477077/140‑1 TTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGAC < 1:81431/140‑1 TAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACT < 2:465285/140‑1 TAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACT < 2:621472/140‑1 ATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGT < 2:370005/140‑1 ATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGT < 2:634299/140‑1 ATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCA < 1:329605/126‑1 ATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGCTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGT < 1:342205/140‑1 CATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCA > 1:134663/1‑140 CATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGT > 1:541587/1‑135 CATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGA > 2:392498/1‑131 CATGACAATCATGACCGCCAACGACCGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGA < 1:389976/131‑1 TGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACA > 2:315067/1‑140 TGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACA > 2:295184/1‑140 GACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAA > 2:116329/1‑140 GACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAA > 1:464588/1‑140 ATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGT < 1:16204/140‑1 TCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTG > 2:33698/1‑140 TCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTG > 2:402854/1‑140 TCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTG > 2:102582/1‑140 TCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTG > 1:398089/1‑140 TCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTG > 1:456261/1‑140 CATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGA > 1:209160/1‑140 CATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATA‑TGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGAC < 1:424636/140‑1 ACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTAC > 1:504393/1‑140 CGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAG > 1:571772/1‑140 CTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTG < 2:278906/140‑1 CTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTG < 1:603825/140‑1 GGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCA < 1:43214/140‑1 GATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAA > 1:250887/1‑140 TTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATT < 1:562972/140‑1 CTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCA < 1:113503/140‑1 GGTTTATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATT < 2:544113/131‑1 TATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCAT > 2:69461/1‑140 TATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCAT > 2:166785/1‑140 TATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCAT < 1:229318/140‑1 TATATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCAT < 1:292028/140‑1 TATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGG > 1:277510/1‑140 TATTGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCA > 2:565704/1‑122 TGGTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTT < 2:194801/140‑1 GTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGT > 2:452366/1‑140 GTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGT < 1:152615/140‑1 GTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGT > 1:196932/1‑140 GTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGT > 2:345863/1‑140 GTGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAAT < 2:51216/126‑1 TGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGTC > 2:179962/1‑140 TGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGTC > 2:141228/1‑140 TGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCAT > 1:320744/1‑132 TGCGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGCGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGTC > 2:64536/1‑140 CGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGTCAG > 2:4247/1‑140 CGCATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACAGTCGCCACAAAAATGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGCTGTCAG > 2:159637/1‑140 CATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGTCAGTT > 1:185563/1‑140 CATAATGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATCCTAATGTCCGCTAAGAGCAGGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCAAAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGTCAGTT > 2:324717/1‑140 TGAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGTCAGTTAAACT > 2:605544/1‑140 AGCAATGTGTTGAGGTTGCATGGACGGTTAAGCCGAGAATACGGTAGTAAGTGAGATATGGGGTTTGGTCATTGTTAATGAGCATGACAATCATGACCGCCAACGACTGGATTCTTCCTTGGTTTATATTGGTGCGCATAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1590907‑1590765 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taatgAGGCGTTATGGTAAATAGCCTATGCTAATGTCCGCTAAGAGCAAGAAGCGGAAGTTGGCAGTTTTGTGGACTGTCCCCACAAAAGTGACTACAGAAATAGTTGCAATTCATAATTGATCATGGGTTGTCAGTTAAACTC < NC_000913/1647024‑1646886 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |