| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,119,259 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (‑147/+330) | yghJ ← / ← glcA | putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3119259 = | 0 (0.000) | 88 (1.430) | 54/278 | 0.1 | 100% | intergenic (‑147/+338) | yghJ/glcA | putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3119267 | 0 (0.000) | 50 (0.810) | 41/278 | 0.3 | 100% | intergenic (‑155/+330) | yghJ/glcA | putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
| ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
ACAATGTTAAAAAATTCGTAACTGGGAGAAATAGTTTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3119132‑3119267‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAG > NC_000913/3583428‑3583566 ACAATGTTAAAAAATTCGTAACTGGGAGAAATAGTTTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTG < 2:89840/140‑1 TGTTAAAAAATTCGTAACTGGGAGAAATAGTTTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGC < 2:647970/140‑1 TGTTAAAAAATTCGTAACTGGGAGAAATAGTTTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGC < 2:325206/140‑1 TTCGTAACTGGGAGAAATAGTTTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:844355/140‑1 ACTGGGAGAAATAGTTTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:708669/140‑1 AAATAGTTTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:891616/140‑1 TTTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGg > 1:449002/1‑139 TTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAGCAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 1:705269/140‑1 TTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:703633/1‑140 ATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 2:642882/140‑1 TGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:969739/1‑140 TATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:693076/1‑140 TATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:615038/1‑140 TATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGGGAAATTTATAAGATTAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:608446/1‑140 TTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT < 2:705619/140‑1 TCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 2:622458/1‑140 TCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 1:746688/1‑140 CTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG > 2:458777/1‑140 AATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 2:967591/140‑1 ACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 2:76650/140‑1 CTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:884486/1‑140 CTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 1:784625/140‑1 CTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:55041/1‑140 TCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:632973/140‑1 CCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC > 1:1021209/1‑140 CTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:877773/140‑1 GAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 2:190364/140‑1 AACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 1:458777/140‑1 GACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 2:639660/1‑140 CATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG > 1:531541/1‑140 TGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC < 1:257520/140‑1 GATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT > 1:999118/1‑140 TAGAAAACAGGTGCAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 1:616954/140‑1 TAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 1:276345/140‑1 TAGAAAACACGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 1:366806/140‑1 AGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT > 1:263638/1‑140 GGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGg > 2:333396/1‑139 GTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTG > 1:512260/1‑140 TAAGAATAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACG > 1:763556/1‑140 TAACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAA > 2:781633/1‑140 ACCCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGC < 2:787536/140‑1 CCCTATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAC < 2:1021209/140‑1 ATACGATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCC > 1:80125/1‑140 ATGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGTCA > 1:899381/1‑140 TGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT > 1:945549/1‑140 TGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT > 1:67643/1‑140 TGTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT > 1:114617/1‑140 aaCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC < 2:696939/138‑1 TCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGAAAAAGCACCGCCGGACATCA > 2:456570/1‑140 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAG > 2:496444/1‑140 ACAATGTTAAAAAATTCGTAACTGGGAGAAATAGTTTTATGCTTTATCTTCTCTAATAACTTCCTCCATTCTTAAGAAAACGACATCATTGATAGAAAACAGGTGAAATTTATAAGAATAACCCCTATACGATGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3119132‑3119267‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAG > NC_000913/3583428‑3583566 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |