| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,501,724 | Δ16,748 bp | IS1‑mediated | insG–fecI | 18 genes insG, yjhB, yjhC, ythA, yjhD, yjhE, insO, insI‑3, insO, insO, yjhV, fecE, fecD, fecC, fecB, fecA, fecR, fecI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4501724 | 4518471 | 16748 | 178 [0] | [0] 179 | insG–fecI | insG,yjhB,yjhC,ythA,yjhD,yjhE,insO,insI‑3,insO,insO,yjhV,fecE,fecD,fecC,fecB,fecA,fecR,fecI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4501723 | 0 (0.000) | 178 (1.110) | 96/278 | 0.1 | 100% | intergenic (+134/+380) | yjgZ/insG | KpLE2 phage‑like element; uncharacterized protein YjgZ/KpLE2 phage‑like element; IS4 putative transposase |
| ? | NC_000913 | 4518472 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
AAGTGATACCTGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGTTATTCCTGGGGTCAGTACTTCAGATCTAGCCTCCGGTACCAGACTAGCTAGCCCCTACGCAACCAAATAAATCAACCATCGTCAGAGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAAT > NC_000913/4501588‑4501860 | aaGTGATACCTGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACTCGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCAggta < 2:1938312‑M1/140‑5 (MQ=255)aaGTGATACCTGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggta < 2:1126794‑M1/140‑5 (MQ=255)aaGTGATACCTGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggta < 1:1381897‑M1/140‑5 (MQ=255) tGATACCTGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatg > 2:1914223‑M1/1‑133 (MQ=255) aTACCTGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgct > 1:2670859‑M1/1‑131 (MQ=255) aCCTGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgc < 2:1010755‑M1/140‑12 (MQ=255) ccTGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgcc < 2:74547‑M1/140‑13 (MQ=255) tGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGTGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaa < 1:1829963‑M1/140‑15 (MQ=255) gCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaac > 1:744312‑M1/1‑125 (MQ=255) gCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaac > 1:1541613‑M1/1‑125 (MQ=255) ccGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaact > 1:1213414‑M1/1‑124 (MQ=255) ccGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaact < 1:1606764‑M1/140‑17 (MQ=255) gTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaactta < 2:665278‑M1/140‑19 (MQ=255) cAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttact > 1:1324489‑M1/1‑120 (MQ=255) gtgtTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAATAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgat < 1:1082651‑M1/140‑24 (MQ=255) gtgtTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgat < 1:2372999‑M1/140‑24 (MQ=255) gtgtTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgat < 1:1727797‑M1/140‑24 (MQ=255) tgtTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatt < 2:2511724‑M1/140‑25 (MQ=255) tgtTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatt < 1:1763886‑M1/140‑25 (MQ=255) tgtTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatt < 2:1470036‑M1/140‑25 (MQ=255) ggCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 1:1337288‑M1/1‑103 (MQ=255) ggCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg < 2:2126563‑M1/140‑38 (MQ=255) ggCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 2:2682564‑M1/1‑103 (MQ=255) ggCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 2:1874340‑M1/1‑103 (MQ=255) ggCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 1:1101651‑M1/1‑103 (MQ=255) ggCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 2:647720‑M1/1‑103 (MQ=255) ccATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg < 2:1445128‑M1/140‑40 (MQ=255) aTAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgat < 2:744312‑M1/140‑42 (MQ=255) aaCCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattt > 2:1163931‑M1/1‑97 (MQ=255) tGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaag > 2:2100030‑M1/1‑93 (MQ=255) gCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaagg > 1:1054702‑M1/1‑92 (MQ=255) gCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaagg > 1:1181393‑M1/1‑92 (MQ=255) gCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaagg < 1:16690‑M1/140‑49 (MQ=255) cAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggt > 2:2045218‑M1/1‑91 (MQ=255) aGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtg > 1:2356787‑M1/1‑90 (MQ=255) ttGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgct > 1:482604‑M1/1‑88 (MQ=255) gggAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttg > 2:352628‑M1/1‑86 (MQ=255) gAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcg < 2:1351578‑M1/140‑57 (MQ=255) aaTTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgt < 1:338207‑M1/140‑58 (MQ=255) aaCGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggctt < 2:1036032‑M1/140‑63 (MQ=255) aaCGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggctt < 1:1736888‑M1/140‑63 (MQ=255) gCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttcca < 1:1163931‑M1/140‑66 (MQ=255) gCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttcca < 1:647720‑M1/140‑66 (MQ=255) acaacaGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtattgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttcc < 2:1177882‑M1/140‑71 (MQ=255) aacaGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccat < 2:164853‑M1/140‑73 (MQ=255) acaGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatc < 1:1914223‑M1/140‑74 (MQ=255) caGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatca < 2:1101651‑M1/140‑75 (MQ=255) caGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatca < 2:2637758‑M1/140‑75 (MQ=255) ggAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcaga < 2:2356787‑M1/140‑77 (MQ=255) gAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagat < 1:1874340‑M1/140‑78 (MQ=255) gAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagat < 2:411067‑M1/140‑78 (MQ=255) cTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcc < 1:1650542‑M1/140‑86 (MQ=255) agagCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctg > 1:2190309‑M1/1‑53 (MQ=255) agCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgct < 2:2420267‑M1/140‑90 (MQ=255) gCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctc < 2:1181393‑M1/140‑91 (MQ=255) aGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccg < 2:2487996‑M1/140‑93 (MQ=255) aGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccg < 1:2045218‑M1/140‑93 (MQ=255) gTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgc < 2:1740334‑M1/140‑94 (MQ=255) tAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgct > 2:2661581‑M1/1‑46 (MQ=255) tAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgct > 1:348412‑M1/1‑46 (MQ=255) tAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgct > 1:172981‑M1/1‑46 (MQ=255) tAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgct > 1:2403421‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaCACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgcta > 2:2324776‑M1/1‑45 (MQ=255) aaCACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctac > 2:1619957‑M1/1‑44 (MQ=255) aaCACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctac > 1:2566961‑M1/1‑44 (MQ=255) cacGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactg > 2:1488992‑M1/1‑42 (MQ=255) cacGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactg < 1:1293197‑M1/140‑99 (MQ=255) acGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactga < 2:1541613‑M1/140‑100 (MQ=255) acGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactga > 1:1134423‑M1/1‑41 (MQ=255) gcgGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaag > 2:2219832‑M1/1‑39 (MQ=255) ggCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcg > 2:852425‑M1/1‑36 (MQ=255) ggCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcg < 2:1097095‑M1/140‑105 (MQ=255) ggCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcg < 1:2478916‑M1/140‑105 (MQ=255) cTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtg > 2:513524‑M1/1‑34 (MQ=255) aaTGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcg < 1:520269‑M1/140‑112 (MQ=255) tGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgta < 2:2190309‑M1/140‑114 (MQ=255) ggTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactggtttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaac > 2:2398510‑M1/1‑25 (MQ=255) ggTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaac > 1:2643189‑M1/1‑25 (MQ=255) ggTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaac < 2:2643189‑M1/140‑116 (MQ=255) aGAATATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggca > 2:2149287‑M1/1‑21 (MQ=255) aaTATGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaa > 2:261560‑M1/1‑19 (MQ=255) tatGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaag < 1:930507‑M1/140‑124 (MQ=255) tatGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaag < 2:21593‑M1/140‑124 (MQ=255) tGAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagca < 2:1324489‑M1/140‑126 (MQ=255) gAGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcac < 1:931251‑M1/140‑127 (MQ=255) aGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcact < 2:842126‑M1/140‑128 (MQ=255) aGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcact > 1:1036180‑M1/1‑13 (MQ=255) aGTTAGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcact > 1:459075‑M1/1‑13 (MQ=255) aGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccg > 1:2220869‑M1/1‑9 (MQ=255) aGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccg > 1:2414735‑M1/1‑9 (MQ=255) aGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccg > 1:2456653‑M1/1‑9 (MQ=255) aGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccg > 1:1620084‑M1/1‑9 (MQ=255) aGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccg > 1:798737‑M1/1‑9 (MQ=255) aGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccg > 1:342881‑M1/1‑9 (MQ=255) aGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccg > 2:1680770‑M1/1‑9 (MQ=255) aGCCCGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccg > 2:1217640‑M1/1‑9 (MQ=255) cccGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccgga > 2:242820‑M1/1‑7 (MQ=255) cccGGCGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccgga < 1:989695‑M1/140‑134 (MQ=255) gcgggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccggacatc < 2:257802‑M1/140‑138 (MQ=255) gcgggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgccggacatc > 2:982665‑M1/1‑3 (MQ=255) | AAGTGATACCTGCCGTCAGGTGTTTGTGCACCGGGCCATAACCTGCAGTTGGGAATTGAACGCCTGACAACAGGAAATGAGCTAGAGCAGTAAACACGCGGGCTGACAATGGGTCAGAATATGAGTTAGCCCGGCGTTATTCCTGGGGTCAGTACTTCAGATCTAGCCTCCGGTACCAGACTAGCTAGCCCCTACGCAACCAAATAAATCAACCATCGTCAGAGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAAT > NC_000913/4501588‑4501860 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |