| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,501,724 | Δ16,748 bp | IS1‑mediated | insG–fecI | 18 genes insG, yjhB, yjhC, ythA, yjhD, yjhE, insO, insI‑3, insO, insO, yjhV, fecE, fecD, fecC, fecB, fecA, fecR, fecI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4501724 | 4518471 | 16748 | 178 [0] | [0] 179 | insG–fecI | insG,yjhB,yjhC,ythA,yjhD,yjhE,insO,insI‑3,insO,insO,yjhV,fecE,fecD,fecC,fecB,fecA,fecR,fecI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4501723 | 0 (0.000) | 178 (1.110) | 96/278 | 0.1 | 100% | intergenic (+134/+380) | yjgZ/insG | KpLE2 phage‑like element; uncharacterized protein YjgZ/KpLE2 phage‑like element; IS4 putative transposase |
| ? | NC_000913 | 4518472 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
ATGTTGTTTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGC > NC_000913/4518336‑4518611 | aagtgatacctgccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaactcgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcaGGTa < 2:1938312‑M2/4‑1 (MQ=255)aagtgatacctgccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTa < 1:1381897‑M2/4‑1 (MQ=255) atacctgccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAAtgct > 1:2670859‑M2/132‑140 (MQ=255) acctgccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAAtgctgc < 2:1010755‑M2/11‑1 (MQ=255) cctgccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGcc < 2:2425380‑M2/12‑1 (MQ=255) cctgccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGcc < 1:68484‑M2/12‑1 (MQ=255) cctgccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGcc < 2:74547‑M2/12‑1 (MQ=255) tgccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgtgtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCaa < 1:1829963‑M2/14‑1 (MQ=255) gccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAAc > 1:744312‑M2/126‑140 (MQ=255) gccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAAc > 2:1650542‑M2/126‑140 (MQ=255) gccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAAc > 2:1482185‑M2/126‑140 (MQ=255) gccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAAc > 1:1541613‑M2/126‑140 (MQ=255) ccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACt < 1:1606764‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACt > 1:1213414‑M2/125‑140 (MQ=255) cgtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACtt > 2:1713511‑M2/124‑140 (MQ=255) gtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTa < 2:665278‑M2/18‑1 (MQ=255) gtcaggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTa < 1:2502320‑M2/18‑1 (MQ=255) caggtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACt > 1:1324489‑M2/121‑140 (MQ=255) gtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaataggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGAt < 1:1082651‑M2/23‑1 (MQ=255) gtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGAt < 1:238336‑M2/23‑1 (MQ=255) gtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGAt < 2:2633693‑M2/23‑1 (MQ=255) gtgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGAt < 1:1727797‑M2/23‑1 (MQ=255) tgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGAtt < 2:2511724‑M2/24‑1 (MQ=255) tgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGAtt < 2:2116729‑M2/24‑1 (MQ=255) tgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGAtt < 2:1107391‑M2/24‑1 (MQ=255) tgtttgtgcaccgggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGAtt < 1:1763886‑M2/24‑1 (MQ=255) gggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcggaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTatgatg > 1:1740334‑M2/105‑140 (MQ=255) ggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATgg > 2:647720‑M2/104‑140 (MQ=255) ggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATgg > 1:1101651‑M2/104‑140 (MQ=255) ggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATgg > 2:2682564‑M2/104‑140 (MQ=255) ggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATgg < 1:404133‑M2/37‑1 (MQ=255) ggccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATgg > 1:1337288‑M2/104‑140 (MQ=255) gccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGt > 2:1163666‑M2/103‑140 (MQ=255) ccataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTg < 2:1445128‑M2/39‑1 (MQ=255) ataacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGAt < 2:744312‑M2/41‑1 (MQ=255) aacctgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGAttt > 2:1163931‑M2/98‑140 (MQ=255) tgcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAg > 2:2100030‑M2/94‑140 (MQ=255) gcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAgg > 1:1181393‑M2/93‑140 (MQ=255) gcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAgg < 1:16690‑M2/48‑1 (MQ=255) gcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAgg > 1:579967‑M2/93‑140 (MQ=255) gcagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAgg > 1:1054702‑M2/93‑140 (MQ=255) cagttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGt > 2:2045218‑M2/92‑140 (MQ=255) agttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTg > 1:2356787‑M2/91‑140 (MQ=255) ttgggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCt > 1:482604‑M2/89‑140 (MQ=255) gggaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTg > 2:352628‑M2/87‑140 (MQ=255) gaattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCg < 2:1351578‑M2/56‑1 (MQ=255) aattgaacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGt < 1:338207‑M2/57‑1 (MQ=255) aacgcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCtt < 2:1036032‑M2/62‑1 (MQ=255) gcctgacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCttcca < 1:1163931‑M2/65‑1 (MQ=255) gacaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCttccatttc > 1:1622903‑M2/72‑140 (MQ=255) acaacaggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTATTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCttccatttcc < 2:1177882‑M2/70‑1 (MQ=255) ggaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGa < 2:2356787‑M2/76‑1 (MQ=255) gaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGAt < 2:411067‑M2/77‑1 (MQ=255) gaaatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGAt < 1:1874340‑M2/77‑1 (MQ=255) aatgagctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGt < 2:1337288‑M2/79‑1 (MQ=255) ctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGtccttcc < 2:1213414‑M2/85‑1 (MQ=255) ctagagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGtccttcc < 1:1650542‑M2/85‑1 (MQ=255) agagcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTg > 1:2190309‑M2/54‑140 (MQ=255) agcagtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCt < 2:2420267‑M2/89‑1 (MQ=255) agtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCg < 2:2487996‑M2/92‑1 (MQ=255) agtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCg < 1:2045218‑M2/92‑1 (MQ=255) gtaaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGc < 2:1740334‑M2/93‑1 (MQ=255) taaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCt > 2:2661581‑M2/47‑140 (MQ=255) taaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCt > 1:172981‑M2/47‑140 (MQ=255) taaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCt > 1:2403421‑M2/47‑140 (MQ=255) taaacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGGGATTTTAAGGGGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCTTAAGATGTCCTTCTTCCTCCCCt > 2:1221729‑M2/47‑140 (MQ=255) aacacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTAc > 2:1619957‑M2/45‑140 (MQ=255) cacgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTg < 1:1293197‑M2/98‑1 (MQ=255) acgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGa < 2:1541613‑M2/99‑1 (MQ=255) acgcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGa > 1:1134423‑M2/42‑140 (MQ=255) gcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAg > 2:2219832‑M2/40‑140 (MQ=255) gcgggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAg > 1:993526‑M2/40‑140 (MQ=255) ggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCg > 2:852425‑M2/37‑140 (MQ=255) ggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCg < 2:1097095‑M2/104‑1 (MQ=255) ggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCg > 1:347393‑M2/37‑140 (MQ=255) ggctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCg > 2:1805632‑M2/37‑140 (MQ=255) ctgacaatgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCgtg > 2:513524‑M2/35‑140 (MQ=255) tgggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTa < 2:2190309‑M2/113‑1 (MQ=255) ggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGGTTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAAc > 2:2398510‑M2/26‑140 (MQ=255) ggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAAc < 2:2643189‑M2/115‑1 (MQ=255) ggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAAc > 1:2643189‑M2/26‑140 (MQ=255) ggtcagaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGCGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAAc > 1:257802‑M2/26‑140 (MQ=255) agaatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCa > 2:2149287‑M2/22‑140 (MQ=255) aatatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCaaa > 2:261560‑M2/20‑140 (MQ=255) tatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAg < 1:930507‑M2/123‑1 (MQ=255) tatgagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAg < 2:21593‑M2/123‑1 (MQ=255) gagttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAc > 1:938710‑M2/15‑140 (MQ=255) agttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt > 1:1036180‑M2/14‑140 (MQ=255) agttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt < 2:842126‑M2/127‑1 (MQ=255) agttagcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt > 1:459075‑M2/14‑140 (MQ=255) agcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCGAAAGCACTGCCg < 1:2038897‑M2/131‑1 (MQ=255) agcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCg > 2:1896199‑M2/10‑140 (MQ=255) agcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCg > 1:2220869‑M2/10‑140 (MQ=255) agcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCg > 1:2414735‑M2/10‑140 (MQ=255) agcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCg > 1:2456653‑M2/10‑140 (MQ=255) agcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCg > 2:2241629‑M2/10‑140 (MQ=255) agcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCg > 2:1499742‑M2/10‑140 (MQ=255) agcccggcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCg > 1:798737‑M2/10‑140 (MQ=255) gcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc < 2:257802‑M2/137‑1 (MQ=255) gcgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc > 2:982665‑M2/4‑140 (MQ=255) | ATGTTGTTTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGC > NC_000913/4518336‑4518611 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |