| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1557505 | 136 (0.890) | coding (534/927 nt) | ddpF | putative D,D‑dipeptide ABC transporter ATP‑binding subunit DdpF | |||||
Only 100 of 2257 total aligned reads displayed.
GCCCATTCTTCCTCCAGCGGTTTATCAATGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTGCGAAGAGAGTGCTCTGGCAATGGCGATACGTTGCCGCTGCCCGCCGGAGAACGCATGAGGCAGGCGGTCGAGATACTCCGGACGAATACCCACCTGCACAGCCAACTCCTCTGCCAACGCTCGCCGCTGTTGTTCACTACTACGCTTAGCTATCCAGAGCGGTTCTGTGATGATGCGCCAC > NC_000913/1557266‑1557742 | ttcttcCTCCAGCGGTTTATCAATGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtat < 1:341295‑M2/240‑6 (MQ=255) ttcttcCTCCAGCGGTTTATCAATGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtat < 2:1329761‑M2/240‑6 (MQ=255) gCGGTTTATCAATGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacat < 1:1330961‑M2/240‑17 (MQ=255) gCGGTTTATCAATGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacat < 2:1169289‑M2/240‑17 (MQ=255) ggTTTATCAATGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacata > 1:291249‑M2/1‑222 (MQ=255) tttATCAATGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaaa > 1:117408‑M2/1‑220 (MQ=255) tttATCAATGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaa > 1:184176‑M2/1‑220 (MQ=255) tttATCAATGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaa > 2:803177‑M2/1‑220 (MQ=255) tGGCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaaacaccaaa > 2:311420‑M2/1‑212 (MQ=255) ggCGGGGAGGGAATCCAGCAATAATCGGGTGTATGGATGTGCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaaacaccaaag < 1:1070858‑M2/239‑29 (MQ=255) 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1:634618‑M2/230‑51 (MQ=255) gtgCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaaacaccaaagagcgttgagatatatctttctgaaaaaaatattattta < 2:43742‑M2/239‑67 (MQ=255) tgCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaaacaccaaagagcgttgagatatatctttctgaaaaaaatattatttata < 2:1261128‑M2/240‑69 (MQ=255) tgCAGGTGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaaacacca < 2:839731‑M2/197‑26 (MQ=255) tGCCGTCAGCACCTGCTGCGCGTCGCCCAGTTCTACAATCTGCCCGAGATACATCACCGCCACCCGATCGCTCATATGACGTATCACCGAGACATTGTGTGAAATCAGCACATAGGTCAGCCCGTGATTTTCCTGTAGCGTTACCAGTAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaaacaccaaagagcg > 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2:333192‑M2/1‑19 (MQ=255) tAAATTGAGGATCTGCGCCcgtattttatggacataaaacaccaaagagcgttgagatatatctttctgaaaaaaatattatttataaaataattaatgaccaaaaaattagtagagggaatggtcattttataagtataatggttaataattacaggacgcactgtggagtggttgatataaatcttaattttttcaatgatattctttat < 1:1602702‑M2/212‑194 (MQ=255) ggATCTGCGCCcgtattttatggacataaaacaccaaagagcgttgagatatatctttctgaaaaaaatattatttataaaataattaatgaccaaaaaattagtagagggaatggtcattttataagtataatggttaataattacaggacgcactgtggagtggttgatataaatcttaattttttcaatgatattctttatagcgtgcga < 2:367780‑M2/213‑203 (MQ=255) cTGCGCCcgtattttatggacataaaacaccaaagagcgttgagatatatctttctgaaaaaaatattatttataaaataattaatgaccaaaaaattagtagagggaatggtcattttataagtata > 2:1226248‑M2/1‑7 (MQ=255) tGCGCCcgtattttatggacataaaacaccaaagagcgttgagatatatctttctgaaaaaaatattatttataaaataattaatgaccaaaaaattagtagagggaatggtcattttataagtataatggttaataattacaggacgcactgtggagtggttgatataaatcttaattttttcaatgatattctttatagcgtgcgattaaaaaacattagtaaactggagaatatg > 1:1300025‑M2/1‑6 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |