| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,971,191 | Δ7,312 bp | IS1‑mediated | [tar]–flhD | [tar], cheW, cheA, motB, motA, flhC, flhD |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1971191 | 1979062–1978503 | 7313–7872 | 30 [0] | [7] 8 | [tar]–[insA‑5] | [tar],cheW,cheA,motB,motA,flhC,flhD,insB‑5,[insA‑5] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1971190 | 0 (0.000) | 30 (0.830) | 22/424 | 0.6 | 100% | coding (1502/1662 nt) | tar | methyl‑accepting chemotaxis protein Tar |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CCCATCAGGCGGCAATGACCGCGTTAGTAAATACTCGTCAAAATGTTTCCCAGTTTGGATCTTGTTCAGCAATTCGCAGTCGTGGCTGAGCCGGTGGTTGCTCACTGGCAGGACGGGATGGTGTTTGCGGTTTATTGGTGAGTGGGCTGGCTGCCAGACGGAACGCGGAAACTGCTTGCGTTAAACGACTCGCCTGTTCTTCCAGCGCAGCGGCGGCGGCAGCTGATTCCTGCACCAGCGATGCGTTCTGTTGCGTGACGCGATCCATTTCCGAAACCGCCAATGCGACTTGATCGATGCCACGGCTCTGTTCATCCGATGCCGATGCAATCTCGCCCATAATGTCAGTCACGCGAGTGACAGCATTGACGATATTGTTCATTGTTTCCCCGGCGCTTTCGACCAGCACCGAACCGGTATCAACGCGTGAGAC > NC_000913/1970993‑1971425 | cccATCAGGCGGCAATGACCGCGTTAGTAAATACTCGTCAAAATGTTTCCCAGTTTGGATCTTGTTCAGCAATTCGCAGTCGTGGCTGAGCCGGTGGTTGCTCACTGGCAGGACGGGATGGTGTTTGCGGTTTATTGGTGAGTGGGCTGGCTGCCAGACGGAACGCGGAAACTGCTTGCGTTAAACGACTCGCCTGTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagat > 2:395192‑M1/1‑198 (MQ=255) cgTTAGTAAATACTCGTCAAAATGTTTCCCAGTTTGGATCTTGTTCAGCAATTCGCAGTCGTGGCTGAGCCGGTGGTTGCTCACTGGCAGGACGGGATGGTGTTTGCGGTTTATTGGTGAGTGGGCTGGCTGCCAGACGGAACGCGGAAACTGCTTGCGTTAAACGACTCGCCTGTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg > 1:172140‑M1/1‑177 (MQ=255) gTCAAAATGTTTCCCAGTTTGGATCTTGTTCAGCAATTCGCAGTCGTGGCTGAGCCGGTGGTTGCTCACTGGCAGGACGGGATGGTGTTTGCGGTTTATTGGTGAGTGGGCTGGCTGCCAGACGGAACGCGGAAACTGCTTGCGTTAAACGACTCGCCTGTTggtaatgactccaacttattggtagtgttttatgttcagataatgcccgatgactt > 2:215657‑M1/1‑162 (MQ=255) gTCAAAATGTTTCCCAGTTTGGATCTTGTTCAGCAATTCGCAGTCGTGGCTGAGCCGGTGGTTGCTCACTGGCAGGACGGGATGGTGTTTGCGGTTTATTGGTGAGTGGGCTGGCTGCCAGACGGAACGCGGAAACTGCTTGCGTTAAACGACTCGCCTGTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattt > 1:25863‑M1/1‑162 (MQ=255) gTCAAAATGTTTCCCAGTTTGGATCTTGTTCAGCAATTCGCAGTCGTGGCTGAGCCGGTGGTTGCTCACTGGCAGGACGGGATGGTGTTTGCGGTTTATTGGTGAGTAGGCTGGCTGCCAGACGGAACGCGGAAACTGCTTGCGTTAAACGACTCGCCTGTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattt > 1:118284‑M1/1‑162 (MQ=255) 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1:178853‑M1/239‑236 (MQ=255) tGTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcata < 2:195442‑M1/208‑205 (MQ=255) | CCCATCAGGCGGCAATGACCGCGTTAGTAAATACTCGTCAAAATGTTTCCCAGTTTGGATCTTGTTCAGCAATTCGCAGTCGTGGCTGAGCCGGTGGTTGCTCACTGGCAGGACGGGATGGTGTTTGCGGTTTATTGGTGAGTGGGCTGGCTGCCAGACGGAACGCGGAAACTGCTTGCGTTAAACGACTCGCCTGTTCTTCCAGCGCAGCGGCGGCGGCAGCTGATTCCTGCACCAGCGATGCGTTCTGTTGCGTGACGCGATCCATTTCCGAAACCGCCAATGCGACTTGATCGATGCCACGGCTCTGTTCATCCGATGCCGATGCAATCTCGCCCATAATGTCAGTCACGCGAGTGACAGCATTGACGATATTGTTCATTGTTTCCCCGGCGCTTTCGACCAGCACCGAACCGGTATCAACGCGTGAGAC > NC_000913/1970993‑1971425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |