New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 285962 = | 75 (0.830) | 4 (0.050) | 4/408 | 7.8 | 4.8% | coding (568/1383 nt) | yagG | putative D‑xylonate transporter YagG |
? | NC_000913 | 286405 = | 89 (1.040) | coding (1011/1383 nt) | yagG | putative D‑xylonate transporter YagG | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATGGATCACCCGGAGTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCT > NC_000913/286166‑286638 | aTGGATCACCCGGAGTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTg < 1:477640/240‑1 (MQ=255) ggATCACCCGGAGTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCa < 1:997493/240‑1 (MQ=255) aTCACCCGGAGTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGc > 2:261460/1‑237 (MQ=255) aTCACCCGGAGTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAg > 2:996657/1‑239 (MQ=255) cccGGAGTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGc > 1:1010165/1‑239 (MQ=255) cccGGAGTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGc > 1:651097/1‑239 (MQ=255) aGTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATgg > 1:982812/1‑240 (MQ=255) gTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATgg > 1:351798/1‑239 (MQ=255) gCGACCCAGTTTTTGCTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTc > 2:363188/1‑239 (MQ=255) cGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCt > 2:572815/1‑239 (MQ=255) cccAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCCCGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACg < 2:40557/240‑1 (MQ=255) cccAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACg < 1:362239/240‑1 (MQ=255) ccAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACg > 1:549677/1‑239 (MQ=255) gTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACgtggt < 1:66553/240‑1 (MQ=255) ttttACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGtggtgg < 2:693194/240‑1 (MQ=255) actttacGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTc > 2:356939/1‑225 (MQ=255) actttacGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACt > 1:114011/1‑239 (MQ=255) tacGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACg < 2:145666/226‑1 (MQ=255) tacGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACgag < 1:567992/240‑1 (MQ=255) ccTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCg < 2:405029/240‑1 (MQ=255) tCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGGGCCGc > 2:875745/1‑239 (MQ=255) gCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGtggtgg < 2:527278/220‑1 (MQ=255) ccaccaTGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAg > 2:910761/1‑238 (MQ=255) aTGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTcgc > 2:899513/1‑240 (MQ=255) tGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTcgcc < 1:600194/240‑1 (MQ=255) ttCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTcgcc < 2:925787/238‑1 (MQ=255) ggCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTAc > 1:375645/1‑213 (MQ=255) cTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCg > 1:41859/1‑239 (MQ=255) cTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGa < 1:856310/240‑1 (MQ=255) gCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACg < 1:127155/239‑1 (MQ=255) tttGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACggg > 2:988514/1‑239 (MQ=255) gCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTgg < 1:419751/240‑1 (MQ=255) ctcctcACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTgg < 2:302014/239‑1 (MQ=255) ctcACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGtt < 1:821787/240‑1 (MQ=255) cACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTtc > 1:113922/1‑239 (MQ=255) ctgctgGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGCCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCacc > 1:353696/1‑240 (MQ=255) tgctgGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCacc < 2:646237/239‑1 (MQ=255) ctgGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCaccta < 1:462957/239‑1 (MQ=255) cTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCa > 1:565170/1‑227 (MQ=255) cTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCa < 2:565161/227‑1 (MQ=255) aCCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGtt < 2:282906/232‑1 (MQ=255) aCCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTg < 1:585746/239‑1 (MQ=255) gTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGAtt > 2:569340/1‑240 (MQ=255) gTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTgg < 1:441326/240‑1 (MQ=255) ggATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcg < 1:43797/240‑1 (MQ=255) gATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgg > 1:1016707/1‑240 (MQ=255) atcatcGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcggg > 2:510055/1‑240 (MQ=255) tcatcGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggg < 1:505724/240‑1 (MQ=255) tcatcGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggg < 2:320747/240‑1 (MQ=255) catcGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggg < 1:686496/239‑1 (MQ=255) catcGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggg < 1:377185/239‑1 (MQ=255) tcgCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCggtg < 2:621117/239‑1 (MQ=255) ccTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGtggtgg > 1:213377/1‑240 (MQ=255) ccTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGtggtgg > 2:487687/1‑240 (MQ=255) ccTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTGTAATACCACCCCGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGcc > 2:459783/1‑204 (MQ=255) tACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGAt < 2:815347/119‑1 (MQ=255) cTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTggg < 2:222702/237‑1 (MQ=255) cTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCt < 2:132889/239‑1 (MQ=255) cTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCt < 2:923294/239‑1 (MQ=255) cTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTg > 1:544906/1‑240 (MQ=255) cTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTGCCTGTTCAGCGTGAAg > 2:454428/1‑201 (MQ=255) cTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGAt > 1:639996/1‑239 (MQ=255) gCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCg > 1:247332/1‑239 (MQ=255) ctgctgATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTAc < 1:492479/240‑1 (MQ=255) gctgGTTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATTCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACgag < 2:867878/127‑1 (MQ=255) gctgATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACg > 1:853442/1‑239 (MQ=255) ggcggAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcagcag < 1:695372/240‑1 (MQ=255) 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1:629843/239‑1 (MQ=255) tCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCa < 1:955185/238‑1 (MQ=255) cgcgCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTg > 2:428037/1‑61 (MQ=255) cgcgCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTg < 1:428043/61‑1 (MQ=255) cgcgCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGcc < 2:696696/240‑1 (MQ=255) cgcgCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGcc < 1:60130/240‑1 (MQ=255) 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cATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTg < 1:323114/239‑1 (MQ=255) tttttGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAg < 2:325617/239‑1 (MQ=255) aaCATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCaccacc > 2:866420/1‑240 (MQ=255) gttcctgttcGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGgcagca 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< 1:407952/239‑1 (MQ=255) cgcTGCAGTGGCTGATGGCTTGTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGc > 2:67811/1‑50 (MQ=255) cTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCggt > 2:417155/1‑230 (MQ=255) | ATGGATCACCCGGAGTTGGCGACCCAGTTTTTACTTTACGGCAGCCTCGCCACCATGTTCGGCTCGCTTTGCTCCTCACGCCTGCTGGGCCGCTTCGACCGCGTCACCGCCTTCAAGTGGATCATCGTCGCCTACTCGCTGATCAGCCTGCTGATTTTCGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCT > NC_000913/286166‑286638 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |