| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 372 (0.710) | 66 (0.170) | 23/84 | NT | 19.7% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 260 (0.660) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630133‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 GGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAG > 1:10927708/1‑68GGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAG > 1:40786516/1‑68 CCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCC > 1:9677355/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:24700765/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:6267598/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:15835166/68‑1 CCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:21184475/1‑67 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:8993257/1‑68 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:12860310/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCCCCAGGCCCGCGCGGG > 1:8713787/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:20505306/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:19350612/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTCAATGGCACCAGACCCGAGCGGG > 1:21757883/1‑68 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:2781879/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:5748892/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:35489247/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:6183739/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:844187/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:13728323/68‑1 CAGCACCTGAAACTCTTCTAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:22261033/68‑1 ACCTGTACCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:8428129/68‑1 ACCTGTACCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:9355240/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGAGCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:15043715/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGgga > 1:41314194/1‑65 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:29099808/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:13264032/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGGCTGGTGC > 1:28897886/1‑66 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGAC > 1:32559965/1‑49 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGGGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:33086841/66‑1 CTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCGGCGGGTGTCTGGTGCCAT > 1:41774362/1‑67 CTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTGGGGTGCCAT > 1:18725469/1‑67 CTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGGCAT > 1:31857651/1‑67 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:26606240/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:4434749/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:33108328/67‑1 TCTTCGCGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAGGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTG < 1:32474175/68‑1 TCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCT > 1:20447008/1‑67 TCTTCGAGCAACGGTCTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTG < 1:24723445/68‑1 ctgCGAGCAACGGTTTATGCAGAGGGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:41247355/65‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:40168225/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:34540611/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCCGAGTTAAGGCCACCAGACCCGCCCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:42500664/67‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCCGACCCGCGCGGGGCTGGTGCGATTCACTCTGCA > 1:19834202/1‑68 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCA < 1:14670097/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCA < 1:28377250/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:30778507/67‑1 GCAACGGTTAATCCAGAGGGAAGGGCACCAGACCCGCGCGGGGCGGGTGCCATTCACTCTGCATAAAC < 1:19743001/68‑1 GGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTATGCATAAACCGTT > 1:21685339/1‑67 TGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAA > 1:2099205/1‑68 TGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCCCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAA < 1:29378550/68‑1 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGGCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:10925793/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCTTTCCCTCTGGAGACCCCGTTGCTCGAtg > 1:13270982/1‑66 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:4807815/1‑68 CAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA > 1:8076591/1‑68 gtcAATGCCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGT < 1:822740/63‑1 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:3407910/1‑67 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:23150319/1‑67 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAG < 1:33776549/65‑1 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAG < 1:20167312/65‑1 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCGGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:11226660/1‑67 tgcCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT < 1:23040304/65‑1 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTGTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTTCAGGT > 1:33021891/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:41247196/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:24386082/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:8875819/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:35693649/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:24374400/1‑68 GCACCCGACCCGCGCGGGTCGGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT < 1:31626919/66‑1 GCACCAGCCCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGCGTTACAGGT > 1:42742373/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:3594006/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:2406834/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:22662666/1‑66 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGCGTTACAGGTGCTG > 1:29625350/1‑68 ACCAGACCCGCGCGGGACTCGTGCCAATCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGTAGACTTACAGGTGCTG > 1:3595336/1‑68 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GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:39822923/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:36276132/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:35712443/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:35554500/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:24529185/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:31994131/1‑68 CGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCG > 1:8753371/1‑68 GGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGG < 1:36852586/68‑1 GGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGG < 1:15578025/68‑1 GTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGT < 1:23597264/67‑1 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG < 1:43199767/67‑1 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG < 1:40960522/67‑1 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:18397583/1‑67 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG < 1:29052649/67‑1 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < 1:14545331/68‑1 GGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630133‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |