| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3851553 = | 547 (1.040) | 42 (0.100) | 13/86 | NT | 11.0% | coding (212/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein |
| ? | CP009273 | 3851602 = | 262 (0.650) | coding (163/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein | |||||
Only 100 of 392 total aligned reads displayed.
GCCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3851632‑3851553‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agtccggcccgtgCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGACTATC > CP009273/3851602‑3851668 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGT < 1:21333496/68‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGT < 1:7533930/68‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:40703345/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:19832602/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:3729759/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:3330885/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:33934908/67‑1 CTACACCAGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:20083599/67‑1 TACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGT > 1:37036940/1‑67 TACACCTGTTCACCGGTTTGAACGCCGGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCCGTC < 1:14550117/68‑1 CACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:29991419/1‑68 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:9486986/68‑1 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:21026056/68‑1 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:18180592/68‑1 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:29016358/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:32544066/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:20555197/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:27042060/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:38586699/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:11239980/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:2303105/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:40383891/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCAACGCTAACCAGTCCGG > 1:3140580/1‑67 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:21853297/68‑1 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:13145435/68‑1 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC > 1:32866831/1‑67 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC > 1:16525944/1‑67 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC > 1:31150970/1‑67 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC > 1:24004695/1‑67 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:17607258/68‑1 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:41372873/68‑1 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCCGCCC > 1:24911340/1‑68 TGTTCACCGGATTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:36636381/68‑1 taACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTAACGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:36008262/3‑68 gCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCTGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:27368564/66‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:31837570/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:19064721/67‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:29545772/67‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:27769688/67‑1 TCACCGGGTGGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:6972163/67‑1 ACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCA < 1:38089952/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:30209848/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:24552783/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:14127496/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:41189545/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:13088070/68‑1 GGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGC < 1:41976182/68‑1 TTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:32994328/67‑1 TTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGT < 1:6577870/67‑1 TTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGT < 1:12649477/67‑1 ACGCCGGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAA < 1:39875981/68‑1 CCGGAGTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:8139032/67‑1 CCGCACTATTTACCGGTATCAACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:41741946/67‑1 cgcACTATTTACCGGTATCTACCCTAACCCGCCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGT < 1:15816225/64‑1 CGGACTATTTCCCGGAATCTCCGCTAACCCGGCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGT < 1:11616684/67‑1 CGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGT < 1:7059816/67‑1 TTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGA < 1:13699325/68‑1 TTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGA < 1:30636673/68‑1 TACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAA < 1:25356429/68‑1 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGC > 1:42358779/1‑68 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:7761171/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:4565599/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:25641738/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:26674492/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:10102262/1‑67 GTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC > 1:15271437/1‑68 GTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC > 1:26085716/1‑68 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGC > 1:35578200/1‑68 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:42910955/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:15177819/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:12323766/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG < 1:13370056/67‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:16406254/66‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |