| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 64557 | 391 (0.740) | 25 (0.060) | 9/94 | NT | 6.2% | coding (1224/2352 nt) | polB | DNA polymerase II |
| ? | CP009273 | = 64577 | 434 (0.980) | coding (1204/2352 nt) | polB | DNA polymerase II | |||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
AATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/64482‑64557‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agccctggcGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT < CP009273/64577‑64511 ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:28599821/68‑1 ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:24048125/68‑1 ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:19327145/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGCCGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:3962360/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:36993057/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:3902972/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:29412290/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:32581825/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:7967518/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:4696701/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:3402269/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:35408502/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:15113818/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:2835298/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:41400350/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:22837106/1‑67 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC < 1:1127753/68‑1 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC < 1:41739644/68‑1 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC > 1:17862751/1‑67 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC > 1:32821137/1‑67 AAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:32274729/1‑68 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:43453704/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:37231008/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:12835703/1‑67 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:41907472/1‑67 AGGTGGGGATGATCGTCGGGTACAGGCTTTTATATTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAATCCCTGGC < 1:33477119/68‑1 AGGTGCGGATGATCGCCGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:14264637/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:22484254/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:2279337/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:15283626/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:13267309/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:7710431/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:34832651/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:17436748/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:3703043/1‑67 GCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATGATAAAGCCCGGGCGGCTACGTGATGGGTTGACGGCCgg > 1:19768631/1‑66 AGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTAT > 1:9071352/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:41554049/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:15688235/1‑68 ACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGT > 1:37459080/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:13940574/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTG > 1:40733324/1‑67 ATCATAAAGCCCGGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGACAGGGCGTTTTGATTCAGTGCTGGTGATGG > 1:27944856/1‑68 CATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:17941696/1‑66 ATAAAGCCCTGGCGGGTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACT > 1:42915234/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:7385650/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:6797968/1‑68 AGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCCCGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:19126042/1‑68 AGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:35665111/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:2705035/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:8920736/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:40271541/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:545603/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:10707616/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:30757464/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:27016911/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGC < 1:399278/35‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCCCGGCCAGGGGTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:9707669/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGGTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:33665131/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:39329413/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:4104214/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:6280226/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:11099355/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:3585528/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:11828661/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:12324634/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:32428831/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:32131923/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:16905611/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:24797267/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:21849093/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:21106565/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:20283630/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:35955247/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:13655077/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:42650684/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:42432960/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:2765147/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:36157915/1‑67 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:19984349/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:40013227/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:16491829/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:862385/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:14642704/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:33893047/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:489212/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:5139445/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:7653292/68‑1 GGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCT < 1:31137189/68‑1 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:33271232/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:5744628/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:10313790/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:20538852/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:18243848/1‑64 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGCCTATAAAAGCCTGT > 1:9793549/1‑68 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:36864273/1‑68 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:35061683/1‑68 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:34214365/1‑68 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:25733279/1‑68 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:28150508/1‑60 AATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/64482‑64557‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agccctggcGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT < CP009273/64577‑64511 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |