| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3293574 = | 541 (1.030) | 22 (0.050) | 9/90 | NT | 5.4% | coding (250/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein |
| ? | CP009273 | 3293608 = | 340 (0.800) | coding (284/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3293649‑3293574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctgcaaacccCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGCGCGTCA > CP009273/3293608‑3293674 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:1042046/67‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCGGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:43379996/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:1541185/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:3898379/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:33714029/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:21713651/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:18718122/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:22797678/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:7906669/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:17138729/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:33317180/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:16231037/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:35237291/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:35901973/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:40814918/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:26662229/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:13988498/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:9768586/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:27142855/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:12023103/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:41051605/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:40885621/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:10910691/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:28222950/68‑1 TGGTTGAGTATCACCAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:20631671/68‑1 TTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:23916321/1‑68 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:31815844/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:4609152/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:19343039/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:33075398/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:34865089/1‑67 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGCCTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:18563003/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:12533115/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:40752867/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAA > 1:11379270/1‑67 AGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:10063681/1‑67 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCTGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:11829922/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:25108478/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:36294326/67‑1 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAGCAGCTCTGCAAAC > 1:21542878/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:22421452/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTCTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:41180326/1‑65 CACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGA < 1:39993344/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:33480744/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:9337784/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTAAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:42105246/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTATAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTCACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:2000205/68‑1 ATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:8052863/56‑1 CAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCG < 1:40190862/68‑1 CAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCG < 1:29696236/68‑1 CAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCG < 1:30415755/68‑1 CGGGGTTTGCAGACTGCCTCACAGCTCAGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGAT < 1:36451490/68‑1 GGGGTGTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATA < 1:41797073/68‑1 TCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT > 1:37312166/1‑67 TCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT > 1:22633687/1‑67 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTC > 1:29468002/1‑68 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT < 1:24450309/66‑1 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT < 1:3249468/66‑1 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT < 1:22945305/66‑1 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT < 1:24500495/66‑1 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT < 1:17964464/66‑1 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT < 1:15522477/66‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |