| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 904473 = | 258 (0.490) | 16 (0.030) | 6/98 | NT | 6.6% | coding (278/1002 nt) | ltaE | L‑allo‑threonine aldolase, PLP‑dependent |
| ? | CP009273 | 904511 = | 229 (0.500) | coding (240/1002 nt) | ltaE | L‑allo‑threonine aldolase, PLP‑dependent | |||||
Only 100 of 459 total aligned reads displayed.
TTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTCGCCGCGTTC > CP009273/904407‑904540 | ttATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCAccg > 1:15600412/1‑67 (MQ=255)actcaggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagg > 1:6426405‑M1/67‑67 (MQ=255)actcaggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagg > 1:32146694‑M1/67‑67 (MQ=255)actcaggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGc > 1:28448459‑M1/67‑68 (MQ=255)acgcaggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagg > 1:40455577‑M1/67‑67 (MQ=255) tcaggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGcc < 1:7826883‑M1/3‑1 (MQ=255) aTCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCAccgcc > 1:1195372/1‑67 (MQ=255) aTCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCAccgcc > 1:13888451/1‑67 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:25901479‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:28914364‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:23250797‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:22447502‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:33416619‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:19042231‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:36029714‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:42012938‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:22641820‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:42753460‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:10050251‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:13432416‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:43016721‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:14536987‑M1/64‑68 (MQ=255) caggccaacctgggcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:11505590‑M1/64‑68 (MQ=255) ccAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACcgccgc > 1:37355835/1‑67 (MQ=255) ccAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACcgccgc > 1:3381297/1‑67 (MQ=255) ccAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACcgccgc > 1:39636789/1‑67 (MQ=255) ccAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACcgccgc > 1:12169478/1‑67 (MQ=255) ccAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACcgccgc > 1:26451547/1‑67 (MQ=255) ccAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACcgccgc > 1:25513485/1‑67 (MQ=255) ccAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACcgccgc > 1:14943690/1‑67 (MQ=255) ggccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCcgc > 1:23426629‑M1/62‑66 (MQ=255) cAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCcgcg > 1:38149426/1‑67 (MQ=255) ccaacctggtcgctctgctcagtcactgcgaacgcggcgaagagtatattgtcggtcagGCCgcgc > 1:11316196‑M1/60‑66 (MQ=255) ggTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCAcc > 1:4329764/1‑68 (MQ=255) aGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCg > 1:35669369/1‑66 (MQ=255) aGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCg > 1:6816857/1‑66 (MQ=255) aGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCg > 1:1079354/1‑66 (MQ=255) aGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGc < 1:16637771/68‑1 (MQ=255) aGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGc < 1:5203611/68‑1 (MQ=255) cGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCt > 1:33635626/1‑67 (MQ=255) cGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCt > 1:3297899/1‑67 (MQ=255) cGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCt > 1:14745273/1‑67 (MQ=255) cGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCt > 1:19913687/1‑67 (MQ=255) cGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCt > 1:2078640/1‑67 (MQ=255) cGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCt > 1:40047398/1‑67 (MQ=255) gCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaa > 1:22146571/1‑68 (MQ=255) gCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCaa > 1:29339713/1‑68 (MQ=255) gCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAAAACTGCCCAGCACCGCCGCGCCCCCGGCTTCaa > 1:30117576/1‑68 (MQ=255) cGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAAc > 1:28622904/1‑68 (MQ=255) cGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAAc > 1:21233418/1‑68 (MQ=255) cGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAAc > 1:4425324/1‑68 (MQ=255) cGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAg < 1:15865341/67‑1 (MQ=255) cGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGa > 1:26315352/1‑68 (MQ=255) ggCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGAt < 1:30722583/68‑1 (MQ=255) gCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATa > 1:17841300/1‑68 (MQ=255) gCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGtt > 1:6272163/1‑68 (MQ=255) gCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGtt > 1:37667112/1‑68 (MQ=255) gggTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCgg > 1:36893139/1‑65 (MQ=255) gggTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCgg > 1:12619598/1‑65 (MQ=255) gggTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCgg > 1:35016322/1‑65 (MQ=255) ggTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTg > 1:31339294/1‑68 (MQ=255) gTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTg > 1:27768569/1‑67 (MQ=255) gTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTg > 1:27941034/1‑67 (MQ=255) gTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTg > 1:41575175/1‑67 (MQ=255) ggTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc < 1:9310742/68‑1 (MQ=255) ggTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc < 1:27113993/68‑1 (MQ=255) ggTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc > 1:38319933/1‑68 (MQ=255) ggTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc < 1:14305489/68‑1 (MQ=255) ggTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc < 1:13690769/68‑1 (MQ=255) ggTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc < 1:12450394/68‑1 (MQ=255) ggTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc < 1:34172724/68‑1 (MQ=255) ggTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGAc < 1:19328513/68‑1 (MQ=255) tGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACaa < 1:18033149/67‑1 (MQ=255) tGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAat < 1:12698535/68‑1 (MQ=255) gagtatattgtcggtcagGCCGCGCCACCGGCTTGAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGCCCGACAat < 1:40983878‑M1/50‑1 (MQ=255) aTACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAatat > 1:43428007/1‑67 (MQ=255) tACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc < 1:813707/68‑1 (MQ=255) atattgtcggtcagGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGCCCGACAatat < 1:203922‑M1/52‑1 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:16112419/1‑67 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:1949950/1‑67 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:38618536/1‑67 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:21407215/1‑67 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:2502434/1‑67 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:2981468/1‑67 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:36650529/1‑67 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:24335028/1‑67 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:4652166/1‑67 (MQ=255) aCTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAAAAGATAGTTATGCTCGGCCTGACCGACAATATAc > 1:6110420/1‑67 (MQ=255) 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aCCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTCGCcgcg > 1:16892425/1‑68 (MQ=255) aCCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTCGCcgcg > 1:35248136/1‑68 (MQ=255) | TTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTCGCCGCGTTC > CP009273/904407‑904540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |