| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2787742 = | 591 (1.120) | 40 (0.090) | 11/96 | NT | 7.8% | coding (131/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
| ? | CP009273 | 2787778 = | 433 (0.960) | coding (167/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter | |||||
Only 100 of 760 total aligned reads displayed.
TGTCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGC > CP009273/2787676‑2787808 | tgtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCggg < 1:16604369/67‑1 (MQ=255)tgtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCggg > 1:17645022/1‑67 (MQ=255)tgtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGc < 1:39327290/68‑1 (MQ=255)tgtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGc < 1:36915780/68‑1 (MQ=255) gtCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGc > 1:352022/1‑67 (MQ=255) tCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGccc > 1:33769970/1‑68 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:38896218/1‑68 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:27058232/1‑68 (MQ=255) cTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:40367566/1‑68 (MQ=255) tATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcg > 1:10884187/1‑67 (MQ=255) accggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCcgg > 1:29221941‑M1/63‑68 (MQ=255) ccggtatcgggcgtggcaaccgccatttccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCcggc < 1:24419295‑M1/7‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTCTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggc < 1:41180889/68‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggc > 1:38267935/1‑68 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggc > 1:12476594/1‑68 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggc > 1:19523641/1‑68 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:10018475/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:35417943/68‑1 (MQ=255) ttGCCGGCGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcg < 1:26730272/68‑1 (MQ=255) tGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcgg < 1:21890841/68‑1 (MQ=255) tGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCcggcgg < 1:24216095/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:37470885/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:3869816/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:27473955/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt < 1:28024811/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:31032933/1‑68 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt < 1:12889826/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt < 1:16284342/68‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGt > 1:43541563/1‑68 (MQ=255) cGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAt < 1:9275244/68‑1 (MQ=255) cGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAt < 1:34640697/68‑1 (MQ=255) cGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAt > 1:36000529/1‑68 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:39651022/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:33123261/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:24840154/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:23854719/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:37938781/68‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTGCCCGCGCCCCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt < 1:32131497/68‑1 (MQ=255) tgtTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTAtt > 1:42100939/1‑66 (MQ=255) tATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTgg < 1:22659829/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTg < 1:5173230/67‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:42401866/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:4868598/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:36466750/68‑1 (MQ=255) aTCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGCCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGc < 1:19045704/68‑1 (MQ=255) tCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTgg > 1:32616231/1‑66 (MQ=255) gcAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATc < 1:14439193/67‑1 (MQ=255) gcAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCt < 1:7538731/68‑1 (MQ=255) aaGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGt < 1:14198464/68‑1 (MQ=255) aaGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGt < 1:30611328/68‑1 (MQ=255) aGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGtt < 1:17196639/68‑1 (MQ=255) aGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGtt < 1:11490199/68‑1 (MQ=255) tCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTc > 1:6318611/1‑67 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCggg < 1:9617259/68‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCggg < 1:10652082/68‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCgg < 1:31565498/67‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCgg > 1:28601630/1‑67 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCgg > 1:13249866/1‑67 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCgg > 1:8972457/1‑67 (MQ=255) ttGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCgg < 1:1125400/67‑1 (MQ=255) ccgccaacatccgcataatcataaccaccagtaGCCCGGCGGTATTTCTGGCCTATGTGTTCGCCgg < 1:7130515‑M1/34‑1 (MQ=255) gTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAGGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt < 1:43166138/68‑1 (MQ=255) gTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCCCCGGGCt < 1:12201470/68‑1 (MQ=255) tCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt > 1:11735272/1‑67 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTa < 1:37352749/67‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:32834268/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:20502983/68‑1 (MQ=255) ggTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:23389444/67‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt > 1:261893/1‑68 (MQ=255) 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cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:40678518/1‑68 (MQ=255) gTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCGTGCGGTATTACTGGCCTATCTTTTCGCCGGGCTACTggtggt < 1:15052882/65‑1 (MQ=39) gTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTggtggt < 1:20174453/65‑1 (MQ=255) gTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTggtggt < 1:15417673/65‑1 (MQ=255) gTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGtt < 1:26455778/66‑1 (MQ=255) gTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCAGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGtt < 1:21071280/66‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:30137843/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:23149721/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:25310540/67‑1 (MQ=255) gCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGAt < 1:18767148/68‑1 (MQ=255) 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taGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg < 1:27804296‑M1/65‑1 (MQ=255) | TGTCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGC > CP009273/2787676‑2787808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |