| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3614794 | NA (NA) | 7 (0.010) | 5/106 | NT | 100% | coding (2243/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3614820 | 0 (0.000) | coding (2269/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
AGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG > CP009273/3614753‑3614886 | aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:10076325‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:825153‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:33072037‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:2966427‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:28331248‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:14184822‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:23998491‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:23740279‑M2/68‑1 (MQ=255) gTGGCGGTGCATAACCGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGGGAGCGGCAGACGGcctttctca > 1:10123557‑M2/1‑58 (MQ=255) tGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacc > 1:3367961‑M2/1‑51 (MQ=255) gCATTACAGGTATGATGACAACGGCCGCCGGCCCGGTGAGCGCCAGACGGcctttctcatcatacct > 1:27331637‑M2/1‑50 (MQ=255) gCATTACAGGTATGATCAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacct > 1:28319253‑M2/1‑50 (MQ=255) tACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaat > 1:18496910‑M2/1‑46 (MQ=255) tACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaat > 1:31803999‑M2/1‑46 (MQ=255) gTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctga > 1:19524072‑M2/1‑9 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgccccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:43123627‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:4037386‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:11268897‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:17263962‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:1053148‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:33666229‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:33754804‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:37732703‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:3860320‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:40082704‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:3017769‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:4073971‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:4138986‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:5127849‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:6861875‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:7328268‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:7555972‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:10379328‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:8679272‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:9973453‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:29467149‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:20866427‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:21194953‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:22481005‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:22555755‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:23149688‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:23165213‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:16763391‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:1592713‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:25561551‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:2966213‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:28347126‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:26561222‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:27989871‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtc > 1:12836657‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtc > 1:17627127‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtc > 1:32418379‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtc > 1:5854855‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtc > 1:37300179‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtc > 1:4053325‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtc > 1:3607705‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:25917827‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:30857297‑M2/63‑61 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:42416801‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:22824861‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:21647003‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:25603070‑M2/68‑67 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:25691530‑M2/1‑2 (MQ=255) | AGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG > CP009273/3614753‑3614886 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |