| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4034176 | NA (NA) | 48 (0.110) | 9/92 | NT | 14.8% | intergenic (+180/+90) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B |
| ? | CP009273 | = 4034200 | 337 (0.640) | intergenic (+204/+66) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B | |||||
Only 100 of 1369 total aligned reads displayed.
GGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCTT > CP009273/4034133‑4034267 | gggCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTT > 1:15920747‑M2/1‑68 (MQ=255) cccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTg > 1:10367462/1‑67 (MQ=37) ccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGgc < 1:15672978/68‑1 (MQ=40) aCTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGCCGGCTGGCCGTctgctttatttgatgccgg < 1:40130195‑M2/67‑20 (MQ=255) aCTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttggtgcctg < 1:10000613‑M2/67‑20 (MQ=255) ACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGaaaaa < 1:24031578‑M1/68‑1 (MQ=255) gCCAGGCATCAACTTAAGCAGGAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcag > 1:27522961‑M2/1‑45 (MQ=255) CCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATACTGACGGATGGCCTTTTTTCATTGGCGCAAAAAAAAAt < 1:37093770‑M1/67‑1 (MQ=255) cAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagt > 1:12670165‑M2/1‑43 (MQ=255) cAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagt > 1:40924751‑M2/1‑43 (MQ=255) ATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGAt < 1:37742714‑M1/68‑1 (MQ=255) aaTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCg > 1:6692846/1‑67 (MQ=255) aTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGAc < 1:35810974/68‑1 (MQ=255) tAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGAc > 1:19338549/1‑66 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCGGACGGGTGGCCTTTTTGTGTTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:20692410/1‑67 (MQ=14) aGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTgg < 1:29435331/66‑1 (MQ=40) aGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGgc > 1:17707423/1‑67 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGcgcg < 1:31476687/67‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:3225234/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:29671552/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:6361743/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:25413860/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:12044532/68‑1 (MQ=255) gCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCt > 1:30813876/1‑68 (MQ=255) cATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTa < 1:23566903/68‑1 (MQ=255) aTCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 1:31273027/68‑1 (MQ=255) cTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCa > 1:303478/1‑68 (MQ=255) gACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGc < 1:24288687/68‑1 (MQ=255) aCGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGAg > 1:19027875/1‑66 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt < 1:24956818/68‑1 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:42709369/1‑68 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:4453317/1‑68 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:34197274‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:35326312‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:39149268‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:43368445‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:5153658‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:9418785‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:16952902/1‑67 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:14444315‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:25889969‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:42190918‑M2/68‑60 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaattttatgcctggcagtttatggcgggcttcctgcccgccaccctccggg > 1:38030748‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:11622465‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:15138364‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:42441039‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:18125079‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:4913956‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:5459690‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:31851510‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:8248232‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc > 1:21624742‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc > 1:13440436‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:21254218‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:4053131‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:41826568‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:7654734‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:26488901‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:22794127‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:36628221‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:42983597‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAc < 1:18602504/67‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAc < 1:26183116/67‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAct < 1:6040717/67‑1 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:34486370‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:32682882‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:19905995‑M2/1‑6 (MQ=255) gCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:7168249‑M2/67‑63 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:9027973‑M2/66‑63 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:10673011‑M2/66‑63 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctcgcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:2694701‑M2/66‑63 (MQ=255) ccTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt < 1:38599457/67‑1 (MQ=255) ccTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt < 1:11100887/67‑1 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:13648777‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:8615065‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:7901328‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:16276885‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:2210064‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:24725352‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:17415689‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:33739046‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:12178507‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:23045167‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:28384944‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:29132338‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:30092255‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:20328758‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:32503784‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:33093268‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:3479898‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:3628122‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:37475620‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:41426707‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:1414939‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgccgggcagtttagggcgggcgtcatgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:27933905‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:13129125/67‑1 (MQ=255) ttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:33463798‑M2/67‑66 (MQ=255) ttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:14756467‑M2/67‑66 (MQ=255) tctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttc > 1:39583124‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttc > 1:22430439‑M2/1‑1 (MQ=255) | GGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCTT > CP009273/4034133‑4034267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |