| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4328027 = | 239 (0.450) | 16 (0.040) | 7/96 | NT | 5.7% | intergenic (‑281/+44) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase |
| ? | CP009273 | 4328055 = | 325 (0.720) | intergenic (‑309/+16) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase | |||||
Only 100 of 524 total aligned reads displayed.
ATGAAAACGTTGCCATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCCCT > CP009273/4327988‑4328122 | acgttatgtgcgtgaaagcgtaaccactattccgctgaaggcgtaattgtttaaataacattacgcct < 1:19070279‑M2/1‑1 (MQ=255) aaaCGTTGCCATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCa < 1:2559662/67‑1 (MQ=255) aaaCGTTGCCATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCa < 1:16171106/67‑1 (MQ=255) atgtgcgtgaaagcgtaaccactaatccgctgaaggcgtaattgtttaaataacattacgccTTCAGc < 1:1567798‑M2/6‑1 (MQ=255) aaCGTTGCCATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGc < 1:10015130/68‑1 (MQ=255) aaCGTTGCCATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGc < 1:5500643/68‑1 (MQ=255) aaCGTTGCCATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGc < 1:13689288/68‑1 (MQ=255) tgcgtgaaagcgtaaccactattccgctggaggcggAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGa < 1:5577618‑M1/32‑1 (MQ=255) tgcgtgaaagcgtaaccactattccgctgaaGGCGTTATGTTTTTTAAACAATTACGCCTTCAGCg < 1:28553575‑M1/35‑1 (MQ=255) cgtgaaagcgtaaccactattccgctggaGGCGTTATGGTATTTTAAGAATTACGCCGTCAGCGGAAt < 1:28378119‑M1/39‑1 (MQ=255) cgtgaaagcgtaaccactattccgctgaaggcggTATGTTATTTTAACAATTACGCCTTCagcggtat < 1:29457012‑M1/34‑4 (MQ=255) gCCATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATa > 1:16432646/1‑68 (MQ=255) cATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGt > 1:3720878/1‑68 (MQ=255) cATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGt > 1:3912457/1‑68 (MQ=255) cATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGt > 1:17454131/1‑68 (MQ=255) aTACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTg < 1:27532404/68‑1 (MQ=255) aTACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTg < 1:10963314/68‑1 (MQ=255) aTACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTg < 1:30588470/68‑1 (MQ=255) aagcgtaaccactataccgctgaaggcgtaattgtttaaataacattacgccTTCAGCGGAATAGTgg < 1:9542356‑M2/16‑1 (MQ=255) aCTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGt > 1:42744708/1‑68 (MQ=255) aCTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGt > 1:29655598/1‑68 (MQ=255) tCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGtt > 1:35134740/1‑67 (MQ=255) tCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGtt > 1:29373115/1‑67 (MQ=255) tCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGtt > 1:5927718/1‑67 (MQ=255) tCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGtt > 1:16936431/1‑67 (MQ=255) aaaGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTAc > 1:31090743/1‑66 (MQ=255) aaaGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTAc > 1:2343347/1‑66 (MQ=255) aaaGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTAc > 1:26790333/1‑66 (MQ=255) aaaGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTAc > 1:15937095/1‑66 (MQ=255) aaaGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTAc > 1:10687513/1‑66 (MQ=255) aaGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCt < 1:4784367/68‑1 (MQ=255) aGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCtt > 1:37835549/1‑68 (MQ=255) aGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCATTCAGCGGAATAGTTGTTACGCtt > 1:14635076/1‑68 (MQ=255) ggCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCtt > 1:12464173/1‑67 (MQ=255) ggCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCtt > 1:19510284/1‑67 (MQ=255) ggCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGAtt > 1:39411344/1‑67 (MQ=255) ccTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCttt < 1:33494177/66‑1 (MQ=255) ccTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCttt < 1:11452065/66‑1 (MQ=255) ccTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTc > 1:29165184/1‑67 (MQ=255) ccTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTc > 1:6294336/1‑67 (MQ=255) ccTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTc > 1:27919396/1‑67 (MQ=255) tAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCAc > 1:9281560/1‑67 (MQ=255) aGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGca < 1:21835771/68‑1 (MQ=255) aGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGca < 1:38012777/68‑1 (MQ=255) aGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGca < 1:43109378/68‑1 (MQ=255) aGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGca < 1:14120778/68‑1 (MQ=255) aGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGca < 1:38858252/68‑1 (MQ=255) ggCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGcac > 1:32544614/1‑68 (MQ=255) gCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGcaca > 1:22874334/1‑68 (MQ=255) gCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGcaca > 1:6480037/1‑68 (MQ=255) gCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGcaca > 1:13991929/1‑68 (MQ=255) ccAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGcac < 1:4124585/66‑1 (MQ=255) ggcggcGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAAc > 1:8663084/1‑68 (MQ=255) cggcgTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAAc < 1:27131259/66‑1 (MQ=255) cggcgTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAAc < 1:1318829/66‑1 (MQ=255) cggcgTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGt > 1:7057540/1‑68 (MQ=255) GGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGt > 1:28290455‑M1/1‑67 (MQ=255) GGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGt > 1:34898557‑M1/1‑67 (MQ=255) GGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCATTCAGCGGAATAGTGCTTACGCTTTCACGCACATAACGTg < 1:22477013‑M1/68‑1 (MQ=255) cgaaattgtttaaataacataacgccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTgg < 1:27233979‑M2/41‑1 (MQ=255) CGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTgg > 1:34465247‑M1/1‑67 (MQ=255) CGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTgg > 1:43419452‑M1/1‑67 (MQ=255) CGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTgg > 1:21389754‑M1/1‑67 (MQ=255) CGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTgg > 1:16760666‑M1/1‑67 (MQ=255) GTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTa < 1:15365549‑M1/68‑1 (MQ=255) GTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGATTTCACGCACATAACGTGGTa < 1:4391987‑M1/68‑1 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:9617701/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:37384159/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:7410906/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:8118351/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:35600714/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:3379401/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:12064310/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:14907955/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:31562221/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATa > 1:23750774/1‑67 (MQ=255) gTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGGGGTAAATa > 1:20734305/1‑67 (MQ=255) tATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACTCACATAACGTGGTAAATACCg < 1:20446953/68‑1 (MQ=255) tATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATAcc < 1:27062902/67‑1 (MQ=255) tATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCg > 1:24750785/1‑68 (MQ=255) ttAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCa > 1:10618701/1‑68 (MQ=255) ttAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCa < 1:29930887/68‑1 (MQ=255) ttAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCa < 1:26014424/68‑1 (MQ=255) ttAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCa > 1:24195196/1‑68 (MQ=255) tAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCaa < 1:41825947/68‑1 (MQ=255) aCAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCaataa > 1:36734899/1‑68 (MQ=255) aCAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCaataa > 1:22054964/1‑68 (MQ=255) aCAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCaataa > 1:17904938/1‑68 (MQ=255) aCAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCaataa > 1:31895009/1‑68 (MQ=255) cAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCaataat < 1:39936688/68‑1 (MQ=255) aaTTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAAtt < 1:42451042/68‑1 (MQ=255) gccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGt > 1:24964159‑M2/4‑67 (MQ=255) gccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGt > 1:40444793‑M2/4‑67 (MQ=255) gccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGt > 1:18417627‑M2/4‑67 (MQ=255) gccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGt > 1:26322316‑M2/4‑67 (MQ=255) gccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGt > 1:10280623‑M2/4‑67 (MQ=255) gccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTc < 1:11943410‑M2/65‑1 (MQ=255) ccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTc > 1:33201401‑M2/3‑67 (MQ=255) ttCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCCCt < 1:19834900/68‑1 (MQ=255) ttCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCCCt < 1:19212643/68‑1 (MQ=255) | ATGAAAACGTTGCCATACTCAAAAGGCCTAAGGCCAGGCGGCGTAATGTTATTTAAACAATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCCCT > CP009273/4327988‑4328122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |