| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 65558 | 483 (0.920) | 29 (0.060) | 8/98 | NT | 5.9% | coding (223/2352 nt) | polB | DNA polymerase II |
| ? | CP009273 | = 65573 | 498 (1.080) | coding (208/2352 nt) | polB | DNA polymerase II | |||||
Only 100 of 616 total aligned reads displayed.
AATTCATCAATTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGAACCTGATCG > CP009273/65507‑65640 | aTTCATCAATTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcg > 1:30654462‑M2/1‑66 (MQ=255) aTTCATCAATTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAc < 1:9431026‑M2/67‑2 (MQ=255) aTTCATCAATTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAc < 1:21406410‑M2/67‑2 (MQ=255) tcatcaATTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgcc < 1:2645906‑M2/68‑5 (MQ=255) catcaCTTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgcca > 1:33513068‑M2/1‑63 (MQ=255) catcaATTGGCTATGCGCGCTACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgcca > 1:14120590‑M2/1‑63 (MQ=255) tcaATTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgccagc > 1:22511658‑M2/1‑61 (MQ=255) caATTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgccagcc > 1:20213647‑M2/1‑60 (MQ=255) aaTTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCgg > 1:29621360/1‑68 (MQ=255) aaTTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCgg > 1:7684727/1‑68 (MQ=255) aaTTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCgg < 1:13125849/68‑1 (MQ=255) aTTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGgt < 1:33012890/68‑1 (MQ=255) aTTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGgt > 1:10769859/1‑68 (MQ=255) aTTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGgt < 1:22041188/68‑1 (MQ=255) aTTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGgt < 1:385574/68‑1 (MQ=255) ttGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgccagccggt > 1:31574273‑M2/1‑57 (MQ=255) ttGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGgtg < 1:26809890/68‑1 (MQ=255) tGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgccagccggtg > 1:36363879‑M2/1‑56 (MQ=255) ggCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgccagccggtgt > 1:24476899‑M2/1‑55 (MQ=255) gATGGGCGCGACAGTAACGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAgg < 1:35407908/68‑1 (MQ=255) gAGGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCC‑‑‑‑gccagccggtgtatggcct > 1:13587492‑M2/1‑48 (MQ=255) tGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgccagccggtgtatgg > 1:39350166‑M2/1‑50 (MQ=255) tGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGc < 1:43550909/67‑1 (MQ=255) gcgcGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgccagccggtgtatggcct > 1:27692918‑M2/1‑47 (MQ=255) gcgACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGc < 1:37216618/68‑1 (MQ=255) gACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCt < 1:15474956/68‑1 (MQ=255) aGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGt > 1:42432796/1‑68 (MQ=255) aaaGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTg < 1:32286253/64‑1 (MQ=255) aaaGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTc > 1:36623565/1‑67 (MQ=255) aaaGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTc > 1:8104544/1‑67 (MQ=255) aaaGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTc > 1:27291634/1‑67 (MQ=255) aGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAcc < 1:6545339/68‑1 (MQ=255) aGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:37905044/1‑67 (MQ=255) aGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:5287497/1‑67 (MQ=255) aGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:27960290/1‑67 (MQ=255) ggCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:7389755/1‑66 (MQ=255) ggCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:28502112/1‑66 (MQ=255) ggCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:31039039/1‑66 (MQ=255) ggCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:11406863/1‑66 (MQ=255) ggCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:19384745/1‑66 (MQ=255) ggCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:43089034/1‑66 (MQ=255) gCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCGGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:29896136/1‑65 (MQ=255) gCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCAc > 1:35749442/1‑65 (MQ=255) ccATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCt > 1:8668447/1‑67 (MQ=255) ccATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCt > 1:38362317/1‑67 (MQ=255) ccATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCt > 1:39656436/1‑67 (MQ=255) ccATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCt > 1:41786957/1‑67 (MQ=255) ccATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCt < 1:10378710/67‑1 (MQ=255) cATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTg < 1:15260956/67‑1 (MQ=255) cATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGc < 1:10069319/68‑1 (MQ=255) cATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGc < 1:21134722/68‑1 (MQ=255) cATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGc < 1:17458945/68‑1 (MQ=255) cATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGc < 1:34865472/68‑1 (MQ=255) cATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGc < 1:6980215/68‑1 (MQ=255) cATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGc < 1:25986795/68‑1 (MQ=255) cATACACCGGCTGGCGGAGAAAATCCTTTACCGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCCCCCtcc < 1:20714596/68‑3 (MQ=255) aTACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCa > 1:21864012/1‑68 (MQ=255) tACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaa < 1:22209750/68‑1 (MQ=255) tACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaa < 1:22926341/68‑1 (MQ=255) acacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAAcgccagccggtgtatggcctttactgtcgcgcccatcgcc < 1:18592299‑M2/68‑41 (MQ=255) acacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaa > 1:3907089/1‑68 (MQ=255) acacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaa > 1:11156575/1‑68 (MQ=255) cacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaaa < 1:23351676/68‑1 (MQ=255) cacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaaa > 1:41184516/1‑68 (MQ=255) cacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaaa > 1:23753512/1‑68 (MQ=255) cacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaaa < 1:2829157/68‑1 (MQ=255) cacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaaa > 1:9059488/1‑68 (MQ=255) cacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaaa > 1:16678698/1‑68 (MQ=255) cacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaaa > 1:34218055/1‑68 (MQ=255) cacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaaa > 1:25633183/1‑68 (MQ=255) cacCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaaa < 1:11850966/68‑1 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCaaatt > 1:25022184/1‑66 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAat > 1:18170644/1‑68 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAat > 1:16032538/1‑68 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAat > 1:28927465/1‑68 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAat > 1:40780785/1‑68 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAat > 1:30192309/1‑68 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAat > 1:35146049/1‑68 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAat > 1:32533940/1‑68 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAat > 1:34460753/1‑68 (MQ=255) acCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAat > 1:24117299/1‑68 (MQ=255) cGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAatat < 1:24740594/68‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAatat > 1:19782773/1‑66 (MQ=255) cTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAatat > 1:5766457/1‑65 (MQ=255) ggCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGa < 1:40457573/68‑1 (MQ=255) ggCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGa < 1:29331240/68‑1 (MQ=255) gCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGa > 1:6089414/1‑67 (MQ=255) ggTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAgc < 1:14485894/67‑1 (MQ=255) ggTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAgc < 1:9641036/67‑1 (MQ=255) gAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGcgcg < 1:36764332/67‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGa < 1:5029620/68‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGa < 1:6312733/68‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGa < 1:14867111/68‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGa < 1:12407489/68‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGa < 1:427263/68‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGa < 1:8353250/68‑1 (MQ=255) tCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGGTCTCCCTGCAAAATATGCTGAACGCGGGGaa > 1:19092166/1‑67 (MQ=255) ccTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGAAcc < 1:3378603/68‑1 (MQ=255) cTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCgg < 1:25257932/61‑1 (MQ=255) aCGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGAACCTGATcg > 1:37617266/1‑68 (MQ=255) | AATTCATCAATTGGCGATGGGCGCGACAGTAAAGGCCATACACCGGCTGGCGGTGAAAATCCTTTAACGCCAGCGGTGTCAGGCGAAAGCCTTGTTCACCCTGCAAAATATGCTGAGCGCGGGGAACCTGATCG > CP009273/65507‑65640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |