| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3999963 | 816 (1.170) | 32 (0.050) | 8/98 | NT | 5.2% | coding (740/1830 nt) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
| ? | CP009273 | = 4000007 | 447 (0.730) | coding (784/1830 nt) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CGCTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3999891‑3999963‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcgcTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAAT < CP009273/4000007‑3999941 CGCTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGC < 1:21685994/68‑1 TCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGC < 1:10228749/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:57916554/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:15236699/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:5405785/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:19750991/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:35362826/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:46997240/68‑1 TCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCT > 1:40593517/1‑67 AGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACT > 1:9224871/1‑68 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGGGGTGTCTTGTACTTTC > 1:15851714/1‑67 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTC > 1:17826022/1‑67 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCGAATTCCCTTGCTTTGCCGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTC > 1:43576731/1‑67 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:27500208/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:25409842/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:16421650/1‑68 TGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCGTCTACTTTCGCGCGGCTGg > 1:22801277/1‑67 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:25328668/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:42122989/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:5802214/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:15044873/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:13665755/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:9061448/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:48907810/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:28664245/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:11691869/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:36977520/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCCGCTGT > 1:34894070/1‑67 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGGCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:20946302/1‑68 AACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGC > 1:48637183/1‑68 ACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCA > 1:16226856/1‑68 AGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGT > 1:41397438/1‑68 AGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGT > 1:46223992/1‑68 AGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGT > 1:25971317/1‑68 AGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGT > 1:12901393/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:52538187/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:44391450/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:45020084/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:29945136/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA < 1:11441392/68‑1 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:47282281/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:38465228/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:13134270/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:57532849/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:56968782/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:24705422/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:37203639/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA < 1:23974437/68‑1 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:22085085/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTA > 1:35400760/1‑46 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTATCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:1077335/1‑68 CCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG > 1:26667454/1‑68 CCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG > 1:49636496/1‑68 CCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG > 1:52420528/1‑68 CCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG > 1:39922786/1‑68 CGCTCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:39053159/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCTCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:12195494/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:43878426/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:50436996/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:51174624/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:725179/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:9130120/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:9280369/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:10882756/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:24180214/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:16555294/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:29705247/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:31146332/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:1163186/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:35220504/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:37673286/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:17576727/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:538267/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:21163569/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:55578408/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:16858469/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:51847944/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:16971742/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:51698506/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:37779926/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:17449192/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:610169/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:28625257/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:15462966/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:46678179/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:31987088/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:334240/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:1335514/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:40628439/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTCGCAGTAGA < 1:3740933/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCGGTTGCAGTAGA < 1:22853154/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGGCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:27056315/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTCGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:40170228/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCGTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:34397360/67‑1 CGCGCTAATTCCCGTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:34369771/68‑1 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA > 1:56400246/1‑68 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA > 1:22065714/1‑68 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA > 1:25713565/1‑68 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA > 1:29772257/1‑68 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA > 1:12004724/1‑68 CGCTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3999891‑3999963‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcgcTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAAT < CP009273/4000007‑3999941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |