| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4156417 = | NA (NA) | 15 (0.020) | 4/112 | NT | NA | intergenic (+204/‑170) | murI/rrsB | glutamate racemase/16S ribosomal RNA of rrnB operon |
| ? | CP009273 | 4197929 = | NA (NA) | intergenic (‑469/‑146) | purH/rrsE | fused IMP cyclohydrolase/phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/16S ribosomal RNA of rrnE operon | |||||
GTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4156480‑4156417‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCGCA > CP009273/4197929‑4197995 GTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCACT < 1:5357288/67‑1 ATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCATCGCTTTTTCTCAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAAT < 1:34788756/68‑1 aAAAGACCAGTGCCGCTACGCTTTTTCACAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGT < 1:50956744/66‑1 TAACGAGCAGTGCCGCTTTGCTTTTTCTCAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGT < 1:24148954/67‑1 cCCGCTTCGCTTTTTCTCCGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCG < 1:11608471/66‑1 GCCGCTTTGCTTTTTCGCCGCGGCACTGCTCTTAAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACT < 1:1309614/65‑1 tAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAAC < 1:18937630/67‑1 acCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCTAAGATACGGATTCTTAACG < 1:53132053/66‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG < 1:46844021/68‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG < 1:9126864/68‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:48617877/1‑68 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG < 1:29472413/68‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:22708656/1‑68 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG < 1:21982643/68‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAAC < 1:43702828/67‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAAC < 1:19191716/67‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAAC < 1:6970465/67‑1 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:1015159/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:35875896/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:26027639/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:3158188/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:33661698/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTAAACG > 1:3184022/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGAAACGGATTCTTAACG > 1:15304219/1‑67 CGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:10271900/1‑68 CGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:10318168/1‑68 GGCACTGCTCTTTAACAATTTCTCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:11971358/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCG > 1:30875327/1‑68 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:9052599/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:51150940/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:45078157/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:33329467/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:55943896/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:52158736/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:52549334/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:8578251/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:6315219/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:58053853/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:55578387/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:38355648/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:1056691/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:11048815/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:12033527/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:14383549/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:14997413/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:18393029/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:19785841/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:22317646/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:25289632/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:30696845/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:30952726/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:31091793/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:31162736/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:33993168/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:34548268/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:34789248/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTAAACGTC > 1:40108765/1‑67 GGCACTGCTC‑TTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:9204463/66‑1 GGCACTGCTATTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCG > 1:48740599/1‑68 GGCACAGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:44358455/1‑67 CACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCGCA > 1:21899460/1‑68 CACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCGC < 1:8323172/67‑1 CACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCG < 1:48388811/44‑1 GTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4156480‑4156417‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCGCA > CP009273/4197929‑4197995 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |