New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4306574 = | 303 (0.430) | 17 (0.030) | 13/98 | NT | 6.6% | coding (462/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase |
? | CP009273 | 4306632 = | 215 (0.350) | coding (404/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase |
GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306646‑4306574 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCATCT > CP009273/4306632‑4306698 GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGC > 1:52794542/1‑68 CACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGGCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAATAACTGGTGCA > 1:991844/1‑68 CACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGGTGTTTGAAAAACTGGTGCA > 1:32091353/1‑68 CACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCA > 1:56857122/1‑68 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:10016870/68‑1 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:46268049/68‑1 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:50770582/68‑1 ACCGGCTTCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:52748441/68‑1 ACCGGCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:52683973/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:5085273/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:41909647/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:45923326/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:55801199/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:48673462/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:16347163/68‑1 GTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC > 1:33744580/1‑68 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:15256735/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:20590036/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:55481869/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:4979953/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:53616115/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:19082660/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:3055264/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:18969703/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:3358875/68‑1 GCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGAT < 1:51883255/68‑1 GCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGAT < 1:51815870/68‑1 GCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTCTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGAT < 1:8848998/68‑1 TCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCA > 1:6446673/1‑68 CTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAG < 1:42493641/68‑1 CTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAG < 1:55302272/68‑1 CTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAG < 1:24056480/68‑1 CTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCCCGGGTCGAACAACTGGAGCAGCGCAGATGCAG < 1:41671631/68‑1 TGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGA < 1:29033982/68‑1 GCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGG > 1:50983999/1‑68 CTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGT > 1:24033839/1‑68 TGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGT < 1:39009964/67‑1 ATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTG > 1:55790415/1‑68 ACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGAC > 1:28509812/1‑67 ACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCC > 1:56720533/1‑68 ACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCG > 1:33507689/1‑68 GCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:16560093/1‑65 GCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCG > 1:23886508/1‑68 GCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCG > 1:45913727/1‑68 AAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGAT > 1:49674450/1‑68 gatGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:49433557/4‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:43189612/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:23170139/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:12857417/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:42309909/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:9714111/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:9626701/1‑68 tGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:3824915/66‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATC > 1:38881388/1‑68 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATC > 1:48996863/1‑68 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:50239766/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:19497092/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:57232683/67‑1 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:28155022/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:40971359/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:7306800/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:34521121/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:46973959/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:11621310/1‑68 GCGCAGAGGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:54197750/1‑68 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCATa > 1:29887723/1‑67 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:52506392/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:36473390/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:8445401/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:8691421/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:1075406/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:36079088/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:11432790/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:56487472/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:14541685/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:22930983/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:52462991/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:27991078/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA < 1:50044698/66‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:4949758/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:35642556/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:40218185/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGGTGATCA > 1:13385494/1‑66 CAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCATCT > 1:36923066/1‑68 GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306646‑4306574 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCATCT > CP009273/4306632‑4306698 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |