| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4328027 = | 341 (0.490) | 34 (0.060) | 12/96 | NT | 8.7% | intergenic (‑281/+44) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase |
| ? | CP009273 | 4328055 = | 419 (0.700) | intergenic (‑309/+16) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
ATTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4328100‑4328027‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attacgccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCCCT > CP009273/4328055‑4328122 ATTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACAT > 1:4876122/1‑68ATTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACA < 1:10593647/67‑1 TTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATT < 1:17966690/68‑1 ACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTAC > 1:1905673/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:26379301/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:50228859/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:45200038/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:24277570/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:25366338/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:43180169/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:26291828/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:49390827/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:43114746/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:42164148/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:42005463/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:39484488/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:35007213/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:31773596/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:30929990/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:7950619/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:52182630/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:53752102/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:57532990/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:57696893/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:57800281/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:13494169/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:13276373/1‑67 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:51082894/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:29399191/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:56671328/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:37279977/1‑68 CACGTTACGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:18159944/68‑1 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:43660286/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAAAAACATTACGCC > 1:8881151/1‑67 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:9477630/68‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:28696511/68‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:55596888/68‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:46798852/68‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:19253862/68‑1 ATGGGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCGTCAGC < 1:36833543/68‑1 GCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTCCGCCTTCAGCGGA < 1:33738465/67‑1 AAAGCGAAACCACAATTCCGCGGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTGCAGCGGAATAGTG < 1:14178321/68‑1 AACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACG < 1:18532561/67‑1 AACCACTATTCCGCTCAAGGCGTAATTGTTTAAAAAACATAACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACG < 1:8676822/67‑1 aaTCCGCCGACGGCGAAATTGTTTAAAAAACATTCCCCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACG < 1:53478284/66‑1 ATTCCGCTGAAGCCGTATTTGTTTAAATAACATTCCGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACG < 1:23353191/68‑1 TCCGCTGAAGGCGTAATTGATAAAATAACATAACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:4063300/68‑1 TCCGCTCAAGGCGTAATTGTTTAAAAACCATTACGCCGTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:32069625/68‑1 GAATGCGTATATGTTTAAATAACATTTCGCCTGCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCAGGCACATAAg < 1:32564077/68‑2 AGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGT < 1:14526295/68‑1 gctTAATTGTTAAAATACCATTACCCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGG < 1:35138715/65‑1 CGTAATTGTTAAAAAAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGG < 1:56062602/67‑1 CGTAATTGTATAAATAACATTCCCCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGG < 1:31199321/67‑1 CGTAATTCTTTAAAAACCATTACGCCTGCCGCGGAATAGTGGTAACGCTTTCACGCACATAACGTGG < 1:19921166/67‑1 AATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAA < 1:28089226/68‑1 AATTGTTAAAATAACATTCCGCCGTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAA < 1:36059144/68‑1 TACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTTCGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCA > 1:51360626/1‑68 TACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCA > 1:21467838/1‑68 TACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCA > 1:28867471/1‑68 TACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCA > 1:7354970/1‑68 CGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGT‑AATACCGTCAATAATTTCAGTC < 1:51974288/68‑1 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTC < 1:10030481/68‑1 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTC < 1:49882998/68‑1 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:1631868/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:18893371/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:18706847/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:54711349/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:55886113/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:17335927/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:22511688/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:57543160/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:6545001/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:11781850/1‑67 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1:7071612/1‑66 CTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTC > 1:36193537/1‑66 CTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTC > 1:8341249/1‑66 CTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTC > 1:4656898/1‑66 CTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAAAACCGGCAATAATTTCAGTC > 1:28671714/1‑66 ATTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4328100‑4328027‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attacgccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCCCT > CP009273/4328055‑4328122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |