| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 442683 | 593 (0.850) | 75 (0.130) | 15/90 | NT | 11.0% | coding (479/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
| ? | CP009273 | = 442722 | 738 (1.310) | coding (440/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase | |||||
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/442606‑442683‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgctgcgccgcCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATCT < CP009273/442722‑442657 TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC < 1:40372243/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT < 1:49176511/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:21324864/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:36859472/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:30513091/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:51072546/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:32179395/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:167338/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:45678189/1‑65 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:27265253/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:19765995/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:13728020/1‑67 AAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGC < 1:54492832/67‑1 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:46736328/67‑1 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC > 1:24655000/1‑67 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:11446254/67‑1 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:40907407/67‑1 AGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGT > 1:55899308/1‑68 ATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGGTACTGTGCGGTta > 1:37030982/1‑65 ATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGGGATCGGCTACTGTGCGGTAA > 1:42108436/1‑67 GCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGT > 1:25393555/1‑68 CCACAGGCTGAAGATAGCCCGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTG > 1:20961090/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTAGTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:1271036/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:11736416/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:34304084/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGGGCGGTAACCGGTGAG > 1:20515576/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGCTCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTC > 1:34388224/1‑67 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:43007660/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:39826915/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCGACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:38632341/1‑68 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GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:46590758/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:49770041/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:52607317/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:53663293/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:10678085/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:10085816/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:1329262/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:18559863/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:34793730/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:20804457/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:21930105/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:27785386/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:29311145/1‑65 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:9530114/68‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:22464976/68‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:34589587/1‑67 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:39733472/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:37916467/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:36375944/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:7582626/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:56258106/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:15316163/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:16415632/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |