| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2499292 | 644 (0.920) | 44 (0.070) | 11/98 | NT | 6.8% | coding (820/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2499321 | 636 (1.040) | coding (791/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase | |||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2499220‑2499292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccggcgTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT < CP009273/2499321‑2499256 CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:28513503/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:30792531/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:32821370/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:15150109/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:34648545/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:10545633/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:36465807/1‑67 TTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCC > 1:29984420/1‑68 CAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGG < 1:31418605/68‑1 CAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGG < 1:33366599/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:35508374/68‑1 AATGCCGATAGCGGGACCGGTGTTATGACCGAAATAGGCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:52570391/68‑1 ATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC > 1:13835226/1‑67 CGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGgg > 1:37810013/1‑66 GCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCC > 1:40053147/1‑68 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGTCCCGGCGTGCGCTGCGAGGAGGGTGACGATGC > 1:9601800/1‑68 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGCCCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATG > 1:4720848/1‑67 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGGCAGCAGGTTGCCGATG > 1:50665811/1‑67 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATG > 1:20486009/1‑67 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATG > 1:21499380/1‑67 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGGTGCCAGCAGGGTGACGATGCCGCGCGGCGGG > 1:52995726/1‑67 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGG > 1:21098296/1‑67 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTTCAG > 1:50931829/1‑68 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAG > 1:38365987/1‑68 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAG > 1:12397726/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGGAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCTTTACTGA > 1:24130606/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:52188748/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:36577791/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:26221895/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:2207696/1‑68 TGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCTGCTGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCAGTACAGAA > 1:14409067/1‑68 TTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCA > 1:48837806/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:6843500/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCGGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:19827022/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:27908767/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:50862148/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:40158954/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:43030169/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:43650610/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGGTAT > 1:39085882/1‑68 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGCTGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTGATG > 1:22961999/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:16609771/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:56332179/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:15234982/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:45208266/1‑67 CCCTGCGTGCGGAGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGA < 1:53746574/68‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGA < 1:22594944/68‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:44368922/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:47531457/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:24619841/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:57085488/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:41935215/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:41529184/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:40888784/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:14078824/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:54455515/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:22499439/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:27077009/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:341117/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:35560284/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:23847762/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:25324084/1‑67 CCCGGCGTGCGCGGCCAGCAGGTTGACGCTGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGGAGGTTATGGgg > 1:10775314/1‑65 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:49317119/1‑66 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:26953169/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:17176296/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA < 1:18601059/68‑1 GCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT > 1:39644543/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGTTGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:15702489/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:2893297/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:13482987/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:4910486/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:52352401/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:27975475/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:4758541/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:21402759/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:45861306/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:56304410/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:43303268/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:5919781/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:8817352/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:11981468/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:24264931/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:24505589/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:49880641/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:51398408/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:29832593/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:47188283/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:44456288/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:20063622/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:42641666/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:42195979/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:18580551/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:36960595/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:3791205/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:16994992/67‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |