| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3538010 | 572 (0.820) | 26 (0.040) | 12/94 | NT | 5.1% | coding (194/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
| ? | CP009273 | = 3538051 | 496 (0.840) | coding (153/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase | |||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
TGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3537935‑3538010‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggcttcggGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < CP009273/3538051‑3537986 TGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCAC > 1:42616431/1‑68TGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCAC > 1:55622350/1‑68 GCTTGCCACCCGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:51453277/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:57093766/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:13786716/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:14049764/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:47301839/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:26203413/1‑67 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAACTGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:27324451/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:14512793/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:49610885/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:34193533/1‑66 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:37664430/1‑66 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACcgg < 1:18384160/67‑4 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:2886152/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:46297269/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:6522675/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:25789078/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT < 1:41071169/68‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:37355448/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:28273790/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:34510501/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:28717884/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:24073862/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:37105319/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:16490862/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:54991128/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:56952121/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:12648450/67‑1 CCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:28106516/1‑68 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCCAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:19284914/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCTGCACGGCTTCGG < 1:9167222/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:51732602/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:46558838/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:1815858/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:52401717/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:3143810/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:36294250/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:2777587/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:39467010/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:39261416/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:8000766/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCACCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:53583293/68‑1 ACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG > 1:58006066/1‑67 ACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG > 1:43467593/1‑67 CTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGGTTCGGGGGTAGGCGGGGGTTT > 1:21495131/1‑68 TCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCGTCGGGCGGAGCCGGGGAGTTG > 1:3671643/1‑68 GCCTCACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGGGGAGCCGGGGGTTTGGTGC > 1:52248538/1‑68 GCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTTGCCGGGGTTTTGGTGg > 1:18917498/1‑67 GCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGGAGCCGGGGTTTTGGTGC > 1:44044238/1‑68 CTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCCGCCCGGCGTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGGGCGg > 1:40480197/1‑67 CCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGGAGCCGGGGAGTTGGTGCGCGGTC > 1:17188251/1‑68 CCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCGTCGCGCGGAGCCGGGGATTTGGTGGGGTGTg > 1:33323403/1‑67 TCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGGTTTGGTGCGCGGTCACGTGCTGATATG > 1:56539096/1‑68 TCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATG > 1:24282867/1‑68 TCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCCGGGGTTTGGTGGGGTGTCACATGCTGATATG > 1:30614064/1‑68 GCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGT > 1:47984922/1‑66 AGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCT > 1:7454868/1‑67 AGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCT > 1:30887705/1‑67 AGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCT > 1:2271427/1‑67 AGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCT > 1:45556316/1‑67 CACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:47651806/1‑68 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:48189625/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:32278507/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:58089600/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:3272310/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:6094574/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:46617385/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:33775204/1‑67 CGGCTTCGGGCGTAGTCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:40160059/68‑1 CGGCTTCGGGCGTAGCGGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:50354080/68‑1 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:54276715/68‑1 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:11182985/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |