| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 726727 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/92 | NT | 100% | coding (1689/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | 3614358 = | 0 (0.000) | coding (1807/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 1149 total aligned reads displayed.
TTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGT > CP009273/726662‑726779 | actgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCAcc > 1:36210834/1‑67 (MQ=255) tgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACcgcg > 1:8635188/1‑68 (MQ=255) tgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACcgcg > 1:14363702/1‑68 (MQ=255) gactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGa > 1:9434532/1‑68 (MQ=255) actgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg > 1:41056434/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:22471785/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:29702654/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg < 1:13828603/67‑1 (MQ=255) tgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGa < 1:37697693/68‑1 (MQ=255) tgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGa > 1:5895401/1‑68 (MQ=255) ggTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGa > 1:31908497/2‑68 (MQ=255) tCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg < 1:44623400/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:26450517/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:3380708/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:32982959/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:26055803/1‑67 (MQ=255) ggTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:27687155/1‑65 (MQ=255) ggTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:35230443/1‑65 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:28499903/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:27352254/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:12399766/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:11765716/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:1516512/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:51921817/1‑68 (MQ=255) tATTTAACCCGGTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGGGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:47293724/68‑1 (MQ=17) tATTTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:11191862/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:55852957/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:37426985/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:7189544/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:6771329/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:34582671/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:5764723/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:57148459/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:56750272/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:55123799/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:12096994/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:50547445/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:48858933/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:48177948/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:46486215/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:46826887/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:18361205/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:16330493/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:30071077/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:14646396/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:23925760/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGGCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:40370762/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATCACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:24641941/68‑1 (MQ=255) aaTGTAACCCGCTATGCCCATGCCCGTTTTGGTCAGGGGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:39752649/67‑1 (MQ=18) tGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTc > 1:41324936/1‑68 (MQ=255) tAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAg > 1:42391810/1‑68 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:39336777/1‑68 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:23446701/1‑68 (MQ=255) cccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:36964011/1‑67 (MQ=255) cccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:47620780/1‑67 (MQ=255) cccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:20963936/1‑67 (MQ=255) cccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:38598766/1‑67 (MQ=255) cccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:43398442/1‑67 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:32500187/1‑66 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:31393737/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:4413946/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:43718263/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:8243842/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:38274125/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:26830588/1‑68 (MQ=255) tATGCCCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:43040902/68‑1 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc > 1:7814114/1‑68 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:20512600/68‑1 (MQ=255) atgacgatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGGCAGTACCGCGCa > 1:56209454/1‑68 (MQ=255) gaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCAt > 1:19709513/1‑67 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:25358173/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:54797808/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:10031228/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGAACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:22773415/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:21570803/1‑67 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg < 1:12975693/68‑1 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:53846852/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:41948656/1‑68 (MQ=255) caatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:16900780/3‑68 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:19363060/1‑67 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:13376410/1‑67 (MQ=255) tgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACa > 1:30713188/1‑68 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:33449156/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:29063020/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:39032791/1‑67 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGcc > 1:18907328/1‑68 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:46065431/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:52549538/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:54238860/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:51371373/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGGGCCGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:45343935/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGGCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:17467747/67‑1 (MQ=255) gTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGt < 1:53306343/68‑1 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg < 1:49524402/68‑1 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg < 1:10620464/68‑1 (MQ=255) ggTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACa < 1:15522545/68‑1 (MQ=40) cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:49974006/67‑1 (MQ=35) cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:17910678/67‑1 (MQ=35) cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:35693303/67‑1 (MQ=35) cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:28080738/67‑1 (MQ=35) | TTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGT > CP009273/726662‑726779 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |