| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 726727 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/92 | NT | 100% | coding (1689/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | 3614358 = | 0 (0.000) | coding (1807/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 692 total aligned reads displayed.
TTAATTGCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCG > CP009273/3614292‑3614425 | ttcacggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAc < 1:57056793‑M2/2‑1 (MQ=255) tcacggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAcc < 1:38982816‑M2/3‑1 (MQ=255) tAATTGCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACC < 1:1085837‑M2/68‑1 (MQ=255) tAATTGCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACC < 1:53429813‑M2/68‑1 (MQ=255) tAATTGCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACC < 1:49796007‑M2/68‑1 (MQ=255) tAATTGCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACC < 1:37951868‑M2/68‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgctcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:40105235‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgcctcagcccttcctcgcggtgcAccg > 1:23051157‑M2/64‑67 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:4502436‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:23617249‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:25073559‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:2650087‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:29310695‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:29817111‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:38410026‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:41290600‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:44715318‑M2/5‑1 (MQ=255) acggcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgc < 1:36984475‑M2/5‑1 (MQ=255) 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gcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgccg > 1:25706169‑M2/61‑67 (MQ=255) gcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgccg > 1:17787306‑M2/61‑67 (MQ=255) gcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgcggtgcAccgccg > 1:57973237‑M2/61‑67 (MQ=255) gcaattaactgtccacggctgtcgtatgcgcggtactgactcagcccttcctcgccgtgcAccgccg > 1:49967758‑M2/61‑67 (MQ=255) gCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGT > 1:12427041‑M2/1‑68 (MQ=255) gCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCG < 1:49157154‑M2/67‑1 (MQ=255) gCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCG < 1:53986351‑M2/67‑1 (MQ=255) gCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCG < 1:47813208‑M2/67‑1 (MQ=255) gCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCG < 1:56188023‑M2/67‑1 (MQ=255) gCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCG < 1:47309268‑M2/67‑1 (MQ=255) 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accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:2328832‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggcgaagct > 1:18302248‑M2/1‑11 (MQ=255) | TTAATTGCCGTGAAAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCG > CP009273/3614292‑3614425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |